34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0436 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0436  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  473  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0167824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0067  hypothetical protein  34.39 
 
 
220 aa  123  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0191  FHA domain-containing protein  32.19 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4677  FHA domain-containing protein  32.89 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3388  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4043  FHA domain-containing protein  33.77 
 
 
211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3940  FHA domain-containing protein  32.19 
 
 
225 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0921  FHA domain containing protein  30.12 
 
 
250 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  31.65 
 
 
236 aa  106  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3359  forkhead-associated  33.62 
 
 
234 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3949  FHA domain-containing protein  30.63 
 
 
188 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0228001 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4680  FHA domain-containing protein  30.36 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4783  FHA domain-containing protein  29.46 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0865  FHA domain-containing protein  29.8 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.646672 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2735  FHA domain-containing protein  28.51 
 
 
213 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.285351  normal  0.211409 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  26.77 
 
 
269 aa  82  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5188  FHA domain containing protein  30.43 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  23.05 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  37.23 
 
 
863 aa  55.1  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2548  FHA-domain containing protein  26.89 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  36.23 
 
 
245 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  28.23 
 
 
513 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  34.04 
 
 
97 aa  49.3  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  40.54 
 
 
946 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4329  FHA domain-containing protein  31.52 
 
 
228 aa  47  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.24475  normal  0.486164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2973  FHA domain containing protein  30.25 
 
 
264 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  27.64 
 
 
518 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  34.18 
 
 
533 aa  45.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  30.43 
 
 
515 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3749  Sigma 54 interacting domain protein  25.65 
 
 
596 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.552068  normal  0.248061 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  32.88 
 
 
153 aa  42.4  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  29.67 
 
 
427 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2656  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.04 
 
 
696 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3448  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.04 
 
 
696 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>