More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1501 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 509 aa  1036    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0038  ApbE family lipoprotein  36.42 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  43.26 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  37.33 
 
 		 170 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  36.81 
 
 		 170 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  37.33 
 
 		 170 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  37.32 
 
 		 174 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  36.67 
 
 		 170 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  37.5 
 
 		 171 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  36.81 
 
 		 164 aa  104  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  25.75 
 
 		 328 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  36 
 
 		 170 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  39.01 
 
 		 171 aa  103  7e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  35.81 
 
 		 179 aa  103  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  36.81 
 
 		 171 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.64 
 
 		 316 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  36.11 
 
 		 171 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  27.99 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  22.82 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  36.84 
 
 		 166 aa  99  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25.96 
 
 		 309 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  27.6 
 
 		 336 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  26.36 
 
 		 351 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  34.56 
 
 		 171 aa  95.9  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  27.65 
 
 		 339 aa  95.1  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  0.00000141849 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.09 
 
 		 349 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  28.42 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  28.52 
 
 		 338 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  25.47 
 
 		 317 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  27.64 
 
 		 315 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  28.57 
 
 		 370 aa  90.1  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  27.71 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.79 
 
 		 336 aa  88.6  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  27.45 
 
 		 337 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  28.08 
 
 		 338 aa  87  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  27.72 
 
 		 386 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  27.74 
 
 		 331 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0541  ApbE family lipoprotein  27.18 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  31.54 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  29.05 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  23.69 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  27.21 
 
 		 331 aa  85.1  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  32.61 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.21 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.7 
 
 		 361 aa  84.3  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  27.57 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  28.32 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  26.92 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  23.34 
 
 		 349 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  26.07 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  27.21 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  27.15 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  26.83 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  33.19 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  23.3 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  27.21 
 
 		 359 aa  80.9  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  27.06 
 
 		 338 aa  80.5  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  31.06 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  23.18 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.72 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  26.78 
 
 		 355 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  28.4 
 
 		 340 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1086  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.09 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  37.82 
 
 		 175 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  28.37 
 
 		 362 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  23.02 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  24.1 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  35.88 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  26.05 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  23.91 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  25.09 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  36.97 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  22.7 
 
 		 350 aa  75.9  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  30.56 
 
 		 340 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  26.06 
 
 		 348 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  25.7 
 
 		 313 aa  76.3  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 374 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 		 350 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  24.59 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0234  ApbE family protein  29.64 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0166965  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  35.9 
 
 		 172 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  25.18 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  24.03 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  29.04 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0237  ApbE family lipoprotein  27.56 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0959  ApbE family lipoprotein  27.42 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  25.52 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1178  ApbE family protein  27.17 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  21.36 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  28.28 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.35 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  32.81 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  26.24 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0214  ApbE family protein  29.29 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  25.8 
 
 		 338 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>