39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2151 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  100 
 
 		 166 aa  346  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  52.14 
 
 		 171 aa  149  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  47.18 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  46.48 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  46.48 
 
 		 171 aa  143  9e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  44.3 
 
 		 170 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  48.87 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  46.45 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  42.14 
 
 		 170 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  42.14 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  42.14 
 
 		 170 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  41.14 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  47.79 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  41.77 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  40.14 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  33.33 
 
 		 192 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  42.15 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  41.35 
 
 		 170 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  38.93 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  37.84 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  36.99 
 
 		 175 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  38.73 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  37.32 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  36.17 
 
 		 172 aa  99.8  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  36.84 
 
 		 509 aa  99  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  39.68 
 
 		 175 aa  99  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  30.72 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  35.66 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  35.16 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  30.61 
 
 		 169 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  25.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  25.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  32.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  29.21 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  42  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  21.36 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>