34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2809 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  100 
 
 		 171 aa  356  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  55.29 
 
 		 170 aa  203  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  54.22 
 
 		 171 aa  202  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  54.22 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  55.29 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  55.29 
 
 		 170 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  54.22 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  53.61 
 
 		 171 aa  202  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  56.79 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  55.29 
 
 		 170 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  49.69 
 
 		 174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  50 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  47.2 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  49.31 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  37.2 
 
 		 170 aa  120  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  36.73 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  39.47 
 
 		 192 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  38.04 
 
 		 170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  38.85 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  37.42 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  36.69 
 
 		 171 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  42.4 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  37.76 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  34.13 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  40.6 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  36 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  35.33 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  33.73 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  34.68 
 
 		 176 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  34.67 
 
 		 165 aa  97.8  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  34.56 
 
 		 509 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  32.45 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  40.48 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  22.16 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>