37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3254 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  100 
 
 
170 aa  347  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  98.24 
 
 
170 aa  342  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  97.65 
 
 
170 aa  340  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  97.65 
 
 
170 aa  340  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  85.29 
 
 
170 aa  307  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  87.06 
 
 
171 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  85.29 
 
 
171 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  85.88 
 
 
171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  85.29 
 
 
171 aa  300  9e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  59.86 
 
 
171 aa  193  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  49.7 
 
 
174 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  51.9 
 
 
179 aa  155  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  47.18 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  41.14 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  40.67 
 
 
192 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  41.3 
 
 
172 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  43.45 
 
 
172 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  34.12 
 
 
170 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  36 
 
 
509 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  36.36 
 
 
171 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  37.58 
 
 
170 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  40.43 
 
 
171 aa  102  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  36.96 
 
 
175 aa  101  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  36.53 
 
 
175 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  36.23 
 
 
175 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  37.2 
 
 
176 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  38.89 
 
 
173 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  33.77 
 
 
170 aa  97.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  38.06 
 
 
165 aa  94.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  37.98 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  37.8 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  31.93 
 
 
177 aa  61.2  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  27.21 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  30.08 
 
 
157 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  30.3 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  22.73 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>