32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2814 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  89.41 
 
 
170 aa  315  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  54.6 
 
 
172 aa  201  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  54.12 
 
 
170 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  52.6 
 
 
173 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  56.14 
 
 
171 aa  198  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  54.71 
 
 
172 aa  195  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  53.12 
 
 
175 aa  194  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  51.74 
 
 
172 aa  184  5e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  52.35 
 
 
175 aa  180  7e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  51.76 
 
 
175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  50.57 
 
 
176 aa  177  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  43.71 
 
 
171 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  52.56 
 
 
165 aa  150  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  39.44 
 
 
166 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  40.82 
 
 
170 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  36.05 
 
 
171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  35.47 
 
 
171 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  39.86 
 
 
170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  35.47 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  39.16 
 
 
170 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  38.36 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  35.47 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  39.16 
 
 
170 aa  107  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  36.54 
 
 
192 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  37.76 
 
 
170 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  31.16 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  32.64 
 
 
179 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  31.08 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  32.82 
 
 
509 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  32.85 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  29.73 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>