39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1076 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  98.25 
 
 		 171 aa  343  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  97.08 
 
 		 171 aa  340  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  91.81 
 
 		 171 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  86.47 
 
 		 170 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  86.47 
 
 		 170 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  85.29 
 
 		 170 aa  304  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  85.29 
 
 		 170 aa  300  9e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  82.35 
 
 		 170 aa  294  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  58.74 
 
 		 171 aa  192  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  50.99 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  46.48 
 
 		 166 aa  143  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  48.59 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  42.18 
 
 		 192 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  40.58 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  36.63 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  36.26 
 
 		 171 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  38.32 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  38.75 
 
 		 170 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  36.09 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  37.5 
 
 		 509 aa  104  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  40.56 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  37.4 
 
 		 175 aa  101  6e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  34.93 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  35.84 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  36.64 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  37.67 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  37.95 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  37.21 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  37.01 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  31.71 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  29.06 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  29.85 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  37.08 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  27.69 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  27.48 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  23.13 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>