32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0039 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  43.26 
 
 		 509 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  40.16 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  35.81 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  39.55 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  37.8 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  37.8 
 
 		 170 aa  92.8  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  37.8 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  37.8 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  38.64 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  37.01 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  35.42 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  35.42 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  37.8 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  35.43 
 
 		 171 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  36.22 
 
 		 171 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  37.04 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  41.67 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  42.73 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  40 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  35.71 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  35.16 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  39.17 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  34 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  36.57 
 
 		 165 aa  72  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  34.29 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  37.14 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  34.91 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  28.41 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  32.09 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  28.35 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>