40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1189 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  92.98 
 
 		 171 aa  330  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  92.4 
 
 		 171 aa  328  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  91.81 
 
 		 171 aa  325  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  88.24 
 
 		 170 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  88.24 
 
 		 170 aa  311  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  87.06 
 
 		 170 aa  310  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  87.06 
 
 		 170 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  80 
 
 		 170 aa  290  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  59.44 
 
 		 171 aa  194  6e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  47.88 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  45.45 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  48.87 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  47.18 
 
 		 164 aa  137  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  39.76 
 
 		 172 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  38.92 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  39.46 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  35.26 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  38.32 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  34.94 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  36.3 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  37.31 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  39.01 
 
 		 509 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  42.18 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  36.57 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  36.25 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  41.89 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  38.1 
 
 		 173 aa  99.8  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  35.43 
 
 		 165 aa  98.6  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  35.1 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  37.8 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  39.29 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  30.71 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  35.58 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  35.96 
 
 		 155 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  23.88 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  29.55 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  30.3 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  32.97 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>