32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1640 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  353  8.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  98.86 
 
 
175 aa  350  4e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  70.41 
 
 
172 aa  250  7e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  53.8 
 
 
172 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  57.49 
 
 
172 aa  186  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  52.35 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  54.17 
 
 
171 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  177  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  50.59 
 
 
170 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  170  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  55.78 
 
 
170 aa  167  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  47.02 
 
 
171 aa  165  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  48.81 
 
 
176 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  45.56 
 
 
165 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  37.59 
 
 
170 aa  103  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  36.57 
 
 
171 aa  102  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  36.99 
 
 
166 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  36.23 
 
 
170 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  31.49 
 
 
192 aa  101  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  36.23 
 
 
170 aa  101  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  36.23 
 
 
170 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  38.1 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  36.64 
 
 
171 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  35.51 
 
 
170 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  36.59 
 
 
171 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  39.17 
 
 
174 aa  97.4  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  35.77 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  37.1 
 
 
179 aa  89.7  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  37.4 
 
 
164 aa  87.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  36.97 
 
 
509 aa  77  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  39.17 
 
 
178 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  26.67 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>