32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5639 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  350  5e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  83.91 
 
 		 172 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  63.87 
 
 		 175 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  64.74 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  62.11 
 
 		 171 aa  214  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  54.91 
 
 		 170 aa  210  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  54.6 
 
 		 172 aa  201  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  58.08 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  57.95 
 
 		 176 aa  198  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  60.9 
 
 		 170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  58.5 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  50.59 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  50.59 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  47.4 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  38.73 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  42.4 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  41.96 
 
 		 170 aa  106  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  41.38 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  41.38 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  40.69 
 
 		 170 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  40.69 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  38.1 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  37.67 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  37.67 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  39.13 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  36.81 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  36.3 
 
 		 166 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  38.81 
 
 		 179 aa  93.6  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  33.77 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  37.24 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  32.77 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  22.22 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>