33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0429 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  51.15 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  49.12 
 
 		 172 aa  153  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  53.69 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  48.81 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  45.56 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  45.56 
 
 		 175 aa  148  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  53.1 
 
 		 170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  52.23 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  51.55 
 
 		 176 aa  144  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  50.68 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  50.32 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  47.56 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  46.01 
 
 		 171 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  36.77 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  35.84 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  37.32 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  42.54 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  35.26 
 
 		 171 aa  99  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  35.43 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  34.68 
 
 		 171 aa  98.2  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  35.53 
 
 		 170 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  35.53 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  35.53 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  38.06 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  37.1 
 
 		 171 aa  91.7  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  31.79 
 
 		 179 aa  84.3  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  32.21 
 
 		 164 aa  84  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  30.12 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  36.57 
 
 		 178 aa  72  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 509 aa  70.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  24.57 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  26.42 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>