36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0271 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  100 
 
 		 157 aa  318  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  54.14 
 
 		 157 aa  183  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  54.14 
 
 		 157 aa  183  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  50.65 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  51.27 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  59.85 
 
 		 277 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  59.26 
 
 		 239 aa  167  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  51.28 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  58.09 
 
 		 155 aa  167  7e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  58.09 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  58.09 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  58.09 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  58.09 
 
 		 155 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  46.45 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  51.09 
 
 		 156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  48.94 
 
 		 153 aa  153  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  45.81 
 
 		 156 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  53.33 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  48.08 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  48.05 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  48.3 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  48.51 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  37.96 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  38.36 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  30.14 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  30.43 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  35.58 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  29.32 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  32.04 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  29.85 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  26.42 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  30.08 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  29.27 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  29.27 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  29.27 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>