36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3289 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  306  5e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  79.87 
 
 		 156 aa  253  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  79.22 
 
 		 156 aa  251  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  64.47 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  63.82 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  66.42 
 
 		 239 aa  185  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  66.67 
 
 		 155 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  65.93 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  65.93 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  65.93 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  65.93 
 
 		 155 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  57.89 
 
 		 153 aa  180  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  65.93 
 
 		 277 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  60 
 
 		 160 aa  179  9.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  56.41 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  56.41 
 
 		 157 aa  179  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  58.71 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  55.84 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  52.56 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  59.7 
 
 		 155 aa  169  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  59.23 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.7 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  46.79 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  41.51 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  32.47 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  27.33 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  29.11 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  32.59 
 
 		 170 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  31.06 
 
 		 170 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  27.69 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  31.06 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  24.63 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  31.06 
 
 		 170 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  31.5 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  31.46 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  30.3 
 
 		 170 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>