30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5166 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  313  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  79.35 
 
 
155 aa  254  5e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  80.65 
 
 
155 aa  228  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  80 
 
 
277 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  79.35 
 
 
239 aa  225  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  226  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  80 
 
 
155 aa  226  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  63.16 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  62.18 
 
 
156 aa  190  7e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  59.62 
 
 
153 aa  183  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  60 
 
 
156 aa  175  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  54.84 
 
 
156 aa  173  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  54.19 
 
 
156 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  53.21 
 
 
157 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  51.92 
 
 
156 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  58.06 
 
 
153 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  48.08 
 
 
157 aa  156  8e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  53.46 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  55.48 
 
 
160 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  48.08 
 
 
158 aa  144  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  34.59 
 
 
169 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  31.82 
 
 
156 aa  87.4  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  28.03 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  30.82 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  26.92 
 
 
166 aa  43.9  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  35.96 
 
 
171 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  34.83 
 
 
171 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>