28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0659 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  339  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  44.36 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  45.86 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  40.52 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  50.79 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  40.38 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  39.74 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  44.53 
 
 		 156 aa  121  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  42.58 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  42.11 
 
 		 160 aa  117  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  43.75 
 
 		 153 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  35.44 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  40.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  40.85 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  37.66 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  37.96 
 
 		 157 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  38.97 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  42.28 
 
 		 277 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  36.15 
 
 		 155 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  29.6 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  28.1 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  25.83 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  30.61 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>