32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1599 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  300  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  70.97 
 
 
153 aa  217  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  70 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  70 
 
 
156 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  58.28 
 
 
155 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  60.58 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  58.71 
 
 
155 aa  168  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  59.26 
 
 
155 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  54.84 
 
 
156 aa  168  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  59.56 
 
 
156 aa  166  9e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  59.26 
 
 
277 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  54.19 
 
 
156 aa  165  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  57.89 
 
 
239 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  51.35 
 
 
157 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  51.35 
 
 
157 aa  157  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  57.33 
 
 
160 aa  157  6e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  56.67 
 
 
160 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  44.87 
 
 
157 aa  141  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  43.59 
 
 
158 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  48.97 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  26.35 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  28.17 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  31.62 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  30.51 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  34.07 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  32.97 
 
 
171 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  34.07 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  32.97 
 
 
171 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>