37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5390 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5390  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5166  hypothetical protein  79.35 
 
 		 155 aa  235  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0901  hypothetical protein  69.92 
 
 		 239 aa  205  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0678724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2077  hypothetical protein  70.9 
 
 		 155 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531924  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0782  hypothetical protein  70.15 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.571559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1980  hypothetical protein  70.15 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.232355  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0674  hypothetical protein  70.15 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.015637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0562  hypothetical protein  70.15 
 
 		 155 aa  203  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0492  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  70.15 
 
 		 277 aa  202  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4964  hypothetical protein  61.84 
 
 		 156 aa  189  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.698378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3396  hypothetical protein  61.84 
 
 		 156 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2737  hypothetical protein  53.85 
 
 		 156 aa  176  9e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1290  hypothetical protein  55.13 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.756839  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3214  hypothetical protein  55.13 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3097  hypothetical protein  58.55 
 
 		 153 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0232  hypothetical protein  53.9 
 
 		 156 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.691436  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0212  hypothetical protein  53.25 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3289  hypothetical protein  57.14 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0867592 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0271  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  51.28 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1599  hypothetical protein  59.69 
 
 		 153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688282  normal  0.585844 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3435  hypothetical protein  55.56 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.167424  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4087  hypothetical protein  54.86 
 
 		 160 aa  147  4e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.399189  normal  0.196197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0225  hypothetical protein  46.75 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00533526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0659  hypothetical protein  37.66 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.217066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4068  hypothetical protein  33.99 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1987  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  94  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1666  hypothetical protein  30.82 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.425395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  37.08 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  35.96 
 
 		 171 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  37.08 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  35.96 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  35.37 
 
 		 170 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  32.58 
 
 		 166 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  34.83 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  36.62 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  34.83 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  34.83 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>