37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3028 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  100 
 
 		 192 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  39.23 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  41.67 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  41.33 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  41.33 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  42 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  44.2 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  41.33 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  42.18 
 
 		 171 aa  118  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  38.92 
 
 		 171 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  38.79 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  38.79 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  40.67 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  44.14 
 
 		 172 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  37.18 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  40.82 
 
 		 173 aa  111  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  39.44 
 
 		 171 aa  109  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  37.34 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  33.33 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  41.79 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  34.62 
 
 		 170 aa  105  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  36.77 
 
 		 165 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  32.04 
 
 		 175 aa  103  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  36.99 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  31.49 
 
 		 175 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  44.92 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  37.67 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  36 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  32.56 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0039  periplasmic protein  38.64 
 
 		 178 aa  92.4  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 509 aa  85.5  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2469  flagellar hook capping protein  55.56 
 
 		 225 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144549  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2565  flagellar hook capping protein  55.56 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0763244  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1388  flagellar hook capping protein  57.58 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0334116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  28.36 
 
 		 161 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  41.18 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1790  flagellar basal body rod modification protein  55.17 
 
 		 235 aa  41.6  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>