18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0525 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0525  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  352  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000185554  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0845  hypothetical protein  35.16 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0853692  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  31.82 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  32.58 
 
 		 170 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  31.82 
 
 		 170 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  31.82 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  31.06 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  40.48 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  30.3 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  29.55 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  28.79 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  29.55 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  34.44 
 
 		 509 aa  51.2  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1498  hypothetical protein  28.24 
 
 		 340 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  34.07 
 
 		 174 aa  45.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  28.91 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  41.18 
 
 		 192 aa  44.3  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  29.67 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>