31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1856 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  333  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0958229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2809  lysozyme  35.29 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.836071  normal  0.952705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2151  periplasmic protein-like protein  30.28 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.398152  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0119  hypothetical protein  31.69 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2849  lysozyme  31.16 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000278291  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5214  hypothetical protein  22.47 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1113  hypothetical protein  29.2 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00248654  hitchhiker  0.000000000773885 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3296  lysozyme  29.2 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0400894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3432  lysozyme  29.2 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.290556  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1076  lysozyme  31.71 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.395577  normal  0.124968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3254  lysozyme  27.21 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0163172  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1189  hypothetical protein  30.71 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12390  hypothetical protein  27.15 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1015  lysozyme  29.2 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.365691  hitchhiker  0.00142183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1011  lysozyme  31.71 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107629  normal  0.0681131 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000840  hypothetical protein  27.27 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06749  hypothetical protein  32.41 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3729  hypothetical protein  28.19 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1075  hypothetical protein  28.04 
 
 		 170 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0429  periplasmic-like protein  24.57 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135823  normal  0.769134 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3028  periplasmic protein-like  28.36 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.348449  hitchhiker  0.000146857 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1640  hypothetical protein  26.67 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.807151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0986  hypothetical protein  26.45 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161516 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0425  hypothetical protein  28.1 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1711  hypothetical protein  26.11 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.560041  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5056  hypothetical protein  29.69 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5639  hypothetical protein  23.66 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3989  hypothetical protein  28.17 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.587131 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3634  hypothetical protein  26.13 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2814  hypothetical protein  29.73 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1501  ApbE family lipoprotein  25.74 
 
 		 509 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>