136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20530  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  100 
 
 		 134 aa  275  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3276  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.17 
 
 		 135 aa  201  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.5 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.51 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.82 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  45.6 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  45.38 
 
 		 135 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  44.8 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  41.94 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  43.09 
 
 		 135 aa  97.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  42.06 
 
 		 136 aa  95.9  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  40.48 
 
 		 136 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.5 
 
 		 174 aa  95.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  44.17 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  40.16 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  46.73 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.8 
 
 		 131 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  40.8 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 131 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.97 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 171 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.59 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  39.2 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 387 aa  87  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  39.37 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 276 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  39.84 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 134 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  40.65 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  41.46 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.59 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.6 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  39.02 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  39.84 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  84  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  83.6  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  40.65 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  41.94 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  41.32 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.67 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.27 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.21 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  39.52 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  39.23 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  38.84 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  40.19 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.52 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  40.54 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.22 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  36.07 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  38.26 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  39.39 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 219 aa  77.4  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  39.37 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  40.34 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  37.3 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.21 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  39.66 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  38.52 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.89 
 
 		 163 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.52 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.71 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  41.58 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  35.38 
 
 		 298 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  39.78 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  35.34 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  38.78 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  30.95 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  36.44 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  38.52 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  31.4 
 
 		 133 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  38.95 
 
 		 179 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 		 165 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  32.31 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.25 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>