More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_17340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_17340  conserved protein of DIM6/NTAB family  100 
 
 
182 aa  360  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00967262  normal  0.0857306 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2582  flavin reductase-like, FMN-binding  39.75 
 
 
162 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.643746  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.67 
 
 
190 aa  87  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  37.58 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  39.51 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  41.61 
 
 
179 aa  85.5  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  35.33 
 
 
311 aa  84.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1607  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  38.19 
 
 
168 aa  84.7  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  38.78 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6495  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.98 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  33.54 
 
 
156 aa  82.4  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.25 
 
 
170 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5977  flavin reductase domain-containing protein  37.33 
 
 
226 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  0.320583 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  37.24 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2517  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  36.88 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118991  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.06 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6086  flavoprotein oxidoreductase  34.18 
 
 
306 aa  81.3  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.97 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  33.75 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  35.56 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  33.33 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.55 
 
 
330 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  38.06 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5938  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
226 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0245052 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6044  flavin reductase domain-containing protein  36.67 
 
 
226 aa  79  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347531  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.62 
 
 
164 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  37.18 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  37.18 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3492  flavin reductase domain-containing protein  37.11 
 
 
196 aa  78.6  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2123  flavin reductase domain protein FMN-binding  35 
 
 
164 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00527978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3643  oxidoreductase, putative  31.65 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0302568  normal  0.0898299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.38 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2088  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000731585  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  39.07 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2261  flavin reductase domain-containing protein  31.65 
 
 
161 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4448  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.24 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.58 
 
 
155 aa  76.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  34.48 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2266  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  33.99 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3262  flavin reductase-like, FMN-binding  31.25 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0281543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3523  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.21 
 
 
191 aa  75.5  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.06 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.97 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1498  putative flavin-dependent reductase  36.36 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0221  flavin reductase domain-containing protein  36.05 
 
 
393 aa  74.7  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  34.44 
 
 
197 aa  74.3  0.0000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  32.73 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5501  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.5 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5585  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.75 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.144422  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0334  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.62 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  39.86 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  31.11 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.12 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6548  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.16 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  36.84 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2092  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34.97 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.934907  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3100  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.86 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  30.87 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.38 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5091  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.504417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4706  flavin reductase-like, FMN-binding protein  29.3 
 
 
204 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4792  flavin reductase domain-containing protein  29.3 
 
 
188 aa  72  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.971177  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3091  flavin reductase domain-containing protein  31.16 
 
 
169 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  30.95 
 
 
180 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2278  flavin reductase domain-containing protein  29.75 
 
 
170 aa  71.6  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.663724 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.82 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  30.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.19 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  27.95 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0847  flavin reductase protein  28.32 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.543841 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1841  flavin reductase-like, FMN-binding  34.06 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  31.11 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  33.91 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  29.38 
 
 
169 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  34.78 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1408  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913162  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1234  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.43 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363078  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.42 
 
 
171 aa  69.7  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  30.46 
 
 
175 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
171 aa  70.1  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3691  flavin reductase domain-containing protein  32.12 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00123529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  33.57 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19500  conserved protein of DIM6/NTAB family  39.01 
 
 
484 aa  68.6  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.224099  decreased coverage  0.00249696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  33.77 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  30.71 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0591  flavin reductase domain-containing protein  36.81 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19053  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.99 
 
 
178 aa  68.6  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.28 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2313  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.22 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  34.57 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  32.5 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.4 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3822  flavin reductase domain-containing protein  34.48 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57201 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  29.38 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.426778  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0196  flavin reductase-like protein, FMN-binding  32.53 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.869968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>