More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3093 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  72.88 
 
 
472 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0932  peptidase M16 domain protein  73.31 
 
 
472 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102466  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3429  peptidase M16 domain-containing protein  72.46 
 
 
472 aa  700    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0907  peptidase M16 domain-containing protein  72.88 
 
 
472 aa  704    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3093  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  970    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0599464  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0879  peptidase M16 domain-containing protein  97.45 
 
 
471 aa  948    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0630981  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0842  peptidase M16 domain-containing protein  96.18 
 
 
471 aa  938    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.060004  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  56.68 
 
 
490 aa  548  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0655  peptidase M16 domain-containing protein  57.5 
 
 
474 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  58.64 
 
 
469 aa  531  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0759  peptidase M16 domain-containing protein  54.7 
 
 
483 aa  496  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0724  Zn-dependent peptidase-like protein  48.43 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  27.91 
 
 
440 aa  158  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  41.26 
 
 
447 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  28.98 
 
 
442 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  27.78 
 
 
919 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  30.36 
 
 
428 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  28.21 
 
 
896 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  29.02 
 
 
422 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  27.59 
 
 
912 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
949 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
949 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  28.5 
 
 
428 aa  143  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  27.99 
 
 
949 aa  143  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  27.66 
 
 
949 aa  143  7e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  30.96 
 
 
470 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  28.43 
 
 
928 aa  142  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  40.65 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  29.81 
 
 
942 aa  141  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  28.87 
 
 
944 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 
950 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  26.25 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  26.79 
 
 
921 aa  139  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  28.27 
 
 
944 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 
950 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  28.27 
 
 
950 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  28.26 
 
 
458 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 
458 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  28.26 
 
 
458 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  28.08 
 
 
948 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  35.18 
 
 
437 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  31.67 
 
 
433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  26.45 
 
 
513 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  26.48 
 
 
954 aa  136  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  32.84 
 
 
436 aa  136  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  28.84 
 
 
945 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  28.41 
 
 
944 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  27.36 
 
 
944 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  34.9 
 
 
428 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  34.26 
 
 
943 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  27.14 
 
 
912 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.81 
 
 
876 aa  134  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2243  peptidase M16 domain-containing protein  26.65 
 
 
476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.193562  normal  0.100659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  28.5 
 
 
945 aa  134  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  27.32 
 
 
945 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0187  protease  27.15 
 
 
514 aa  133  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  33.07 
 
 
448 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  27.85 
 
 
929 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  28.09 
 
 
974 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  28.64 
 
 
944 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2725  hypothetical protein  27.25 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2598  hypothetical protein  27.25 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  31.83 
 
 
463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  33.58 
 
 
904 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  29.24 
 
 
958 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.72 
 
 
901 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  27.63 
 
 
943 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4762  peptidase M16 domain-containing protein  28.04 
 
 
479 aa  131  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.250673  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  35.68 
 
 
429 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2144  peptidase M16 domain-containing protein  23.95 
 
 
453 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00773461  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  28.06 
 
 
949 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  26.65 
 
 
957 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
464 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  24.95 
 
 
508 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  31.01 
 
 
903 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  32.34 
 
 
959 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  24.88 
 
 
476 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  26.62 
 
 
443 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  26.62 
 
 
443 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  25.92 
 
 
443 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  33.33 
 
 
952 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  27.7 
 
 
952 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  27.01 
 
 
441 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 
443 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  36.79 
 
 
429 aa  126  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  25.18 
 
 
463 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  26.4 
 
 
443 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  25.67 
 
 
918 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  38.01 
 
 
423 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  27.96 
 
 
422 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  30.04 
 
 
434 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  25.68 
 
 
469 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0785  M16 family peptidase  23.43 
 
 
415 aa  124  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  24.69 
 
 
431 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  24.63 
 
 
464 aa  124  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1775  peptidase M16 domain-containing protein  33.2 
 
 
438 aa  124  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  25.37 
 
 
461 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  25.84 
 
 
443 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  26.54 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  26.54 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>