More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0655 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0655  peptidase M16 domain-containing protein  100 
 
 		 474 aa  969    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.126336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3824  peptidase M16 domain-containing protein  59.29 
 
 		 469 aa  560  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000529085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0759  peptidase M16 domain-containing protein  59.62 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3445  peptidase M16 domain-containing protein  57.14 
 
 		 490 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3093  peptidase M16 domain-containing protein  57.5 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0599464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0879  peptidase M16 domain-containing protein  57.3 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0630981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0842  peptidase M16 domain-containing protein  56.4 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.060004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0941  peptidase M16 domain-containing protein  54.95 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0932  peptidase M16 domain protein  54.51 
 
 		 472 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0102466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0907  peptidase M16 domain-containing protein  54.51 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3429  peptidase M16 domain-containing protein  54.29 
 
 		 472 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0724  Zn-dependent peptidase-like protein  47.48 
 
 		 478 aa  431  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  32.27 
 
 		 949 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  32.27 
 
 		 949 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  32.27 
 
 		 949 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  32.18 
 
 		 949 aa  176  6e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  31.4 
 
 		 950 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  31.24 
 
 		 944 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  31.24 
 
 		 950 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  31.24 
 
 		 950 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  32.43 
 
 		 944 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  30.93 
 
 		 944 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  30.74 
 
 		 974 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  30.95 
 
 		 943 aa  170  6e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  29.49 
 
 		 944 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  30.34 
 
 		 945 aa  163  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  32.02 
 
 		 944 aa  159  7e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  30.07 
 
 		 945 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0081  peptidase M16 domain-containing protein  34.54 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.197532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3569  peptidase M16 domain-containing protein  31.75 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.368012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  27.55 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0108  peptidase M16 domain protein  27.4 
 
 		 422 aa  150  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02705  putative protease  26.2 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0863  peptidase M16 domain protein  30.63 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.282828  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2363  putative zinc proteinase  29.37 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19030  predicted Zn-dependent peptidase  32.22 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.498908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4128  peptidase M16 domain-containing protein  29.63 
 
 		 437 aa  146  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  30.05 
 
 		 470 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3215  peptidase M16 domain-containing protein  27.45 
 
 		 510 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  32.66 
 
 		 429 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  27.74 
 
 		 945 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0931  peptidase M16 domain-containing protein  30.59 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1782  peptidase M16 domain-containing protein  28.74 
 
 		 530 aa  143  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.636723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  26.49 
 
 		 919 aa  143  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4238  peptidase M16 domain protein  33.55 
 
 		 436 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.259515  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  28.61 
 
 		 958 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0376  putative zinc protease protein  26.65 
 
 		 508 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.535365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0404  peptidase M16 domain protein  29.34 
 
 		 442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0092  peptidase M16 domain protein  26.57 
 
 		 482 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.6 
 
 		 442 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3491  peptidase M16 domain-containing protein  28.99 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3796  peptidase M16-like  28.84 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0607988  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0209  peptidase M16 domain protein  29.4 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.61941  normal  0.477171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0207  peptidase M16 domain-containing protein  29.4 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0549198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  32.79 
 
 		 954 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4256  peptidase M16 domain-containing protein  29.4 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.802915  normal  0.163527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4130  peptidase M16 domain-containing protein  29.4 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  27.98 
 
 		 947 aa  138  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0320  peptidase M16 domain protein  33.69 
 
 		 904 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812117  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  27.9 
 
 		 959 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0739  processing peptidase  25.6 
 
 		 539 aa  137  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  27.52 
 
 		 948 aa  137  4e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  28.51 
 
 		 947 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  33.33 
 
 		 901 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  28.33 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  28.92 
 
 		 443 aa  136  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  29.66 
 
 		 952 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3747  peptidase M16 domain-containing protein  28.94 
 
 		 448 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  27.49 
 
 		 896 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  25.76 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0298  peptidase M16-like  30.14 
 
 		 903 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  28.09 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  28.15 
 
 		 954 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  27.25 
 
 		 461 aa  134  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  29.62 
 
 		 921 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  28.09 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  29.1 
 
 		 969 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  30.43 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  30.23 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1582  peptidase M16 domain protein  31.51 
 
 		 434 aa  133  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.157753  normal  0.0912908 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  30.23 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06870  predicted Zn-dependent peptidase  35.06 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.677092  normal  0.0591627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  35.06 
 
 		 959 aa  132  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  27.21 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  26.54 
 
 		 465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  28.05 
 
 		 947 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  26.14 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  26.05 
 
 		 464 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  29.38 
 
 		 443 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1800  peptidase M16 domain-containing protein  26.86 
 
 		 492 aa  130  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.296573  normal  0.835018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0871  peptidase M16 domain protein  37.61 
 
 		 423 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5791  peptidase M16 domain protein  27.86 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0298791 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4370  peptidase M16-like  24.56 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.345763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  26.46 
 
 		 876 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  27.45 
 
 		 950 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  26.63 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  26.63 
 
 		 457 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 		 929 aa  127  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  35.4 
 
 		 952 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  26.63 
 
 		 441 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>