More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_19810 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_19810  Ni2+-binding GTPase, urease/hydrogenase maturation protein  100 
 
 
213 aa  428  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.942626  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2829  hydrogenase accessory protein HypB  48.28 
 
 
216 aa  192  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11720  hydrogenase accessory protein HypB  50 
 
 
217 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.708429  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7255  hydrogenase accessory protein HypB  41.29 
 
 
292 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.634166  normal  0.351792 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0756  hydrogenase accessory protein HypB  38.68 
 
 
218 aa  154  8e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.901261  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1274  hydrogenase accessory protein HypB  40.2 
 
 
277 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.388022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2357  hydrogenase accessory protein HypB  41.95 
 
 
254 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0142835 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2180  hydrogenase accessory protein HypB  39.5 
 
 
217 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.352538 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4493  hydrogenase accessory protein HypB  37.81 
 
 
300 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0448  hydrogenase accessory protein HypB  35.5 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0478  hydrogenase nickel incorporation  41.29 
 
 
237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  0.249483 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2052  hydrogenase accessory protein HypB  37.44 
 
 
269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.858375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1949  hydrogenase accessory protein HypB  37.62 
 
 
253 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4012  hydrogenase accessory protein HypB  37.93 
 
 
225 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1307  hydrogenase accessory protein HypB  35.47 
 
 
219 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00162338  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1933  hydrogenase nickel incorporation protein  36.57 
 
 
223 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.125072  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0475  hydrogenase accessory protein HypB  37.37 
 
 
288 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0438  hydrogenase accessory protein HypB  33.5 
 
 
284 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.408549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0802  hydrogenase accessory protein HypB  35.82 
 
 
279 aa  142  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.287566  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0427  hydrogenase accessory protein HypB  33.5 
 
 
284 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1563  hydrogenase accessory protein HypB  35.96 
 
 
224 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0444465  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3165  hydrogenase accessory protein HypB  36.32 
 
 
218 aa  142  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0461052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4943  hydrogenase accessory protein HypB  37.93 
 
 
225 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000345448  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1536  hydrogenase accessory protein HypB  37.88 
 
 
326 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107781  normal  0.0565242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3363  hydrogenase accessory protein HypB  38.92 
 
 
220 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1383  hydrogenase accessory protein HypB  38.42 
 
 
268 aa  141  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0873622  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0929  hydrogenase accessory protein HypB  37.5 
 
 
224 aa  141  9e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3978  hydrogenase accessory protein HypB  36.63 
 
 
352 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2886  hydrogenase accessory protein HypB  38.38 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.896709  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2482  hydrogenase accessory protein HypB  39.51 
 
 
239 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0330  hydrogenase accessory protein HypB  39.7 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0164285  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0534  hydrogenase accessory protein HypB  39.71 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3288  hydrogenase accessory protein HypB  38.38 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3108  hydrogenase accessory protein HypB  39.8 
 
 
306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4096  hydrogenase accessory protein HypB  37.69 
 
 
312 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0866  hydrogenase accessory protein HypB  36.82 
 
 
305 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0718  hydrogenase accessory protein HypB  36.82 
 
 
257 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3365  hydrogenase expression/synthesis, HypA  39.6 
 
 
263 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.186715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5247  hydrogenase accessory protein HypB  34.12 
 
 
224 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2157  hydrogenase accessory protein HypB  39.3 
 
 
289 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.126874  normal  0.122693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2145  hydrogenase accessory protein HypB  39.59 
 
 
261 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2488  hydrogenase accessory protein HypB  40.1 
 
 
308 aa  136  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.248349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2191  hydrogenase accessory protein HypB  39.59 
 
 
261 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0044  hydrogenase accessory protein HypB  33.17 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2132  hydrogenase accessory protein HypB  39.09 
 
 
263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364389 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1644  hydrogenase accessory protein HypB  35.64 
 
 
270 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2010  hydrogenase accessory protein HypB  36.15 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1398  hydrogenase accessory protein HypB  37.95 
 
 
246 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3922  hydrogenase accessory protein HypB  37.37 
 
 
322 aa  135  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.320935  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0506  NI2+-binding GTPase protein HypB  38.81 
 
 
289 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1810  hydrogenase accessory protein HypB  33.99 
 
 
292 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2417  hydrogenase accessory protein HypB  37 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0580161  normal  0.128777 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3066  hydrogenase accessory protein HypB  34.65 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.13732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02577  GTP hydrolase involved in nickel liganding into hydrogenases  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0962  hydrogenase accessory protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1431  hydrogenase accessory protein HypB  34.83 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0305  hydrogenase accessory protein HypB  39.8 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2165  hydrogenase accessory protein HypB  37.02 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.303898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1602  hydrogenase accessory protein HypB  36.76 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3904  hydrogenase accessory protein HypB  32.67 
 
 
284 aa  134  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02542  hypothetical protein  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3150  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2864  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1497  hydrogenase accessory protein HypB  34.83 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2852  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.484483 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0985  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.225312 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1239  hydrogenase accessory protein HypB  34.33 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1213  hydrogenase accessory protein HypB  34.33 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0929883  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0302  hydrogenase accessory protein HypB  37.13 
 
 
296 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3015  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.32 
 
 
290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1212  GTP hydrolase, accessory liganding Ni into hydrogenases, HypB  33.33 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113745 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0726  hydrogenase accessory protein HypB  35.18 
 
 
247 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.932617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0534  hydrogenase accessory protein HypB  34.65 
 
 
275 aa  132  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1046  hydrogenase accessory protein HypB  35.68 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.432152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2436  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  37.62 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4559  hydrogenase accessory protein HypB  38.12 
 
 
301 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08010  hydrogenase accessory protein HypB  36.14 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3979  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1648  hydrogenase accessory protein HypB  41.92 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3060  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0585288 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1079  hydrogenase accessory protein HypB  38.54 
 
 
297 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0788642  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3044  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2977  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3008  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.82 
 
 
290 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0101113 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1098  hydrogenase accessory protein HypB  35 
 
 
278 aa  131  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3978  hydrogenase accessory protein HypB  38.38 
 
 
283 aa  131  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.83518  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2781  hydrogenase accessory protein HypB  36.04 
 
 
276 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2007  hydrogenase nickel incorporation  37.31 
 
 
321 aa  131  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0298  hydrogenase accessory protein HypB  36.27 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3761  hydrogenase accessory protein HypB  35.64 
 
 
307 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3214  hydrogenase accessory protein HypB  38.69 
 
 
303 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3748  hydrogenase accessory protein HypB  36.87 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0175  hydrogenase nickel incorporation protein  35.64 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0652  hydrogenase accessory protein HypB  35.18 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2552  hydrogenase accessory protein HypB  35.64 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.146085  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3881  hydrogenase accessory protein HypB  33.5 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1893  hydrogenase accessory protein HypB  35.86 
 
 
295 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1786  hydrogenase accessory protein HypB  34.98 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000796055  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3165  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  35.32 
 
 
290 aa  128  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.591749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50480  hydrogenase nickel incorporation protein HypB  38.12 
 
 
303 aa  128  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0494141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>