232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2512 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  54.82 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  57.73 
 
 
206 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50 
 
 
204 aa  203  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  55.34 
 
 
210 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  46.08 
 
 
208 aa  184  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  41.55 
 
 
212 aa  176  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.58 
 
 
210 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  41.55 
 
 
210 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  41.83 
 
 
241 aa  168  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  44.28 
 
 
212 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  42.03 
 
 
210 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.22 
 
 
210 aa  164  8e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  41.55 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  41.55 
 
 
210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  41.55 
 
 
210 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  40.1 
 
 
210 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  36.82 
 
 
208 aa  131  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  34.2 
 
 
190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.04 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  37.04 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.82 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  24.58 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  24.57 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  24.57 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  24 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  32.21 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  23.43 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  33.79 
 
 
169 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  34.46 
 
 
169 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
190 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.83 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  29.34 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  31.72 
 
 
187 aa  60.1  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  30.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  30.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  30.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  30.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  30.17 
 
 
172 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  31.85 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 
331 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  36.29 
 
 
167 aa  57.8  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.22 
 
 
182 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2119  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 
388 aa  57  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0158071  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  22.6 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  29.45 
 
 
185 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3290  DJ-1 family protein  35.21 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  37.6 
 
 
167 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  25.41 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  31.13 
 
 
182 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  23.78 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  29.61 
 
 
172 aa  55.5  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  36.05 
 
 
180 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
190 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
190 aa  55.1  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3449  PfpI family intracellular peptidase  34.4 
 
 
172 aa  54.7  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  36.05 
 
 
180 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.37 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1118  DJ-1 family protein  38.4 
 
 
190 aa  54.3  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  26.49 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  28.49 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  26.83 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  29.55 
 
 
329 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.08 
 
 
183 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3590  PfpI family intracellular peptidase  35.2 
 
 
172 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.638149  normal  0.0943675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  29.24 
 
 
191 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  31.97 
 
 
204 aa  52  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  36.45 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  23.76 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  38 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  31.13 
 
 
173 aa  50.4  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  33.66 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  27.42 
 
 
151 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.17 
 
 
226 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  29.01 
 
 
322 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  25.84 
 
 
198 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  32.81 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  28.99 
 
 
180 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  35.64 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  32.03 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1048  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.93 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  26.97 
 
 
201 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  35.29 
 
 
185 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  32.03 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  34.02 
 
 
171 aa  48.5  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  31.31 
 
 
191 aa  48.5  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  34.69 
 
 
209 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  32.26 
 
 
192 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  30.1 
 
 
187 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  30.17 
 
 
326 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  29.6 
 
 
174 aa  48.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>