113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4072 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 		 202 aa  405  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.87 
 
 		 204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.82 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  57.98 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  56.28 
 
 		 210 aa  214  9e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  48.68 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  43.56 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  37.44 
 
 		 208 aa  148  7e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  37.25 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.68 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  34.01 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  33 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  32.99 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  32.99 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.17 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  33.67 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  32.99 
 
 		 210 aa  131  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  38.59 
 
 		 208 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  31.41 
 
 		 190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  36.93 
 
 		 192 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  27.72 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  27.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  38.2 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.52 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  22.78 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  22.22 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  22.22 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  21.67 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  22.22 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.94 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  36.63 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  26.98 
 
 		 151 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  26.98 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.98 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  26.98 
 
 		 190 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.85 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  32.54 
 
 		 333 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  24 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 331 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1845  putative protease  38.38 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  32.06 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  37.37 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  28.23 
 
 		 322 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  26.4 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  26.4 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  26.4 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  26.4 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  26.4 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2299  DJ-1/PfpI family protein  27.41 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.168949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  24.6 
 
 		 186 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  35.9 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  30.77 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1869  PfpI family intracellular peptidase  30.95 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  28.57 
 
 		 333 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  38.24 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  25 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  28.91 
 
 		 340 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1758  PfpI family intracellular peptidase  33.9 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0834819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  23.49 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  27.34 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  24.7 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2865  peptidase C56, PfpI  33.33 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 330 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5126  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 357 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1098  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.93 
 
 		 360 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  23.53 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4832  transcriptional regulator  31.71 
 
 		 393 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.304205  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  26.36 
 
 		 331 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3214  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5153  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 360 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  32.43 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  30.25 
 
 		 333 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  30.63 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  29.85 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  35.16 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.215201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03020  predicted intracellular protease  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0552  intracellular protease, PfpI family  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 356 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 330 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3345  PfpI family intracellular peptidase  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3636  PfpI family intracellular peptidase  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0545  PfpI family intracellular peptidase  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.712189  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5071  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 357 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3618  intracellular peptidase, PfpI family  25.28 
 
 		 172 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4473  intracellular peptidase, PfpI family  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3508  intracellular protease, PfpI family  32.28 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  33.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02971  hypothetical protein  25.28 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  25 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4548  AraC family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 357 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 327 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  27.2 
 
 		 321 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0966  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  33.33 
 
 		 182 aa  42  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000883438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1956  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 396 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976768  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1864  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 410 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4267  PfpI family intracellular peptidase  33.98 
 
 		 193 aa  42  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346156  normal  0.0318533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>