112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0569 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
212 aa  420  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.28 
 
 
210 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  48.68 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.25 
 
 
204 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  40.39 
 
 
208 aa  152  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  44.94 
 
 
206 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  40.76 
 
 
241 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  37 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  37.19 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  42.5 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.75 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  36.68 
 
 
210 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.69 
 
 
210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  36.18 
 
 
210 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  35.68 
 
 
210 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  35.68 
 
 
210 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  35.68 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  40.44 
 
 
192 aa  103  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  28.27 
 
 
190 aa  98.2  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  31.22 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  30.26 
 
 
196 aa  89.7  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  32.75 
 
 
196 aa  61.2  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  24.29 
 
 
194 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.41 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.04 
 
 
190 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  26.04 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  26.04 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  23.43 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2409  peptidase C56, PfpI  34.09 
 
 
167 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000025656  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  23.43 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  22.86 
 
 
194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  23.3 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  26.04 
 
 
190 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  25.75 
 
 
186 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.43 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.04 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  36.97 
 
 
182 aa  51.6  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1159  PfpI family intracellular peptidase  31.51 
 
 
167 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.123312  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1454  PfpI family intracellular peptidase  32.77 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.747809  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  36.08 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  25 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  36.29 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  36.08 
 
 
169 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  35.48 
 
 
191 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  21.89 
 
 
190 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2023  PfpI family intracellular peptidase  32.23 
 
 
193 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.297632  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  36.89 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  27.82 
 
 
182 aa  48.1  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  24.73 
 
 
192 aa  48.1  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 
334 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0062  intracellular protease, PfpI family  29.66 
 
 
169 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.594492  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  26.24 
 
 
202 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  25.6 
 
 
151 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  34.71 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  30.16 
 
 
171 aa  47  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1994  PfpI family intracellular peptidase  28.93 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.964546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  23.35 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0362  peptidase C56, PfpI  28.93 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  34.95 
 
 
204 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1742  PfpI family intracellular peptidase  31.45 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.419318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 
322 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0483  intracellular protease, PfpI family  31.71 
 
 
187 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0416  hypothetical protein  31.4 
 
 
192 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.894968  normal  0.433586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0332  intracellular protease, PfpI family  28.93 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  29.41 
 
 
331 aa  45.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0310  peptidase C56, PfpI  28.1 
 
 
209 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2697  intracellular protease, PfpI family  29.41 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  0.0728869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0893  intracellular protease, PfpI family  30.58 
 
 
195 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  30.67 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 
337 aa  45.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0932  PfpI family intracellular peptidase  30.58 
 
 
192 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  34.86 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  28.73 
 
 
192 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  31.97 
 
 
190 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  27.78 
 
 
328 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  27.85 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0334  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.53 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0271  intracellular protease, PfpI family  28.93 
 
 
192 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  28.49 
 
 
192 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2222  intracellular protease, PfpI family  36.08 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.648289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1197  ThiJ/PfpI family protein  28.1 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  28.57 
 
 
333 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1159  ThiJ/PfpI family protein  28.1 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.685694  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1578  PfpI family intracellular peptidase  32.63 
 
 
171 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592224  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  27.42 
 
 
189 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0881  PfpI family intracellular peptidase  34.65 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.365986  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  28.44 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  32.23 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1389  PfpI family intracellular peptidase  28.67 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0691524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3754  intracellular protease, PfpI family  29.75 
 
 
201 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  29.27 
 
 
194 aa  43.1  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3024  PfpI peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C56  22.54 
 
 
166 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0470812  normal  0.272847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1303  peptidase C56, PfpI  29.84 
 
 
193 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4458  PfpI family intracellular peptidase  29.75 
 
 
192 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.453472  hitchhiker  0.00124261 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3527  intracellular peptidase, PfpI family  25.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3564  PfpI family intracellular peptidase  25.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3458  intracellular peptidase, PfpI family  25.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  26.77 
 
 
183 aa  42.7  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3456  intracellular protease 1  25.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3624  intracellular peptidase, PfpI family  25.32 
 
 
172 aa  42.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>