120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2564 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
241 aa  494  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  49.52 
 
 
212 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.34 
 
 
210 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  46.38 
 
 
208 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  44.39 
 
 
210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.06 
 
 
210 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  43.9 
 
 
210 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  44.39 
 
 
210 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  44.39 
 
 
210 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  44.39 
 
 
210 aa  194  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  42.44 
 
 
210 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.17 
 
 
204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.83 
 
 
210 aa  168  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  43.56 
 
 
202 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  42.65 
 
 
210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  40.76 
 
 
212 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  41.8 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  35.75 
 
 
190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  33.83 
 
 
208 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  32.66 
 
 
192 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3165  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.26 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.64 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  29.02 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  29.28 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  28.18 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  27.62 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  28.18 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  28.18 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3678  ThiJ/PfpI  31 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  24.24 
 
 
190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  24.21 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  24.21 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  24.21 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  23.28 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0946  DJ-1 family protein  34.11 
 
 
187 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.892246  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  24.85 
 
 
186 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  25.44 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.21 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  32.17 
 
 
331 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  24.24 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.53 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  23.67 
 
 
190 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  26.99 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 
198 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  26.99 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  26.7 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  26.21 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2324  DJ-1 family protein  32.12 
 
 
191 aa  49.7  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  22 
 
 
151 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  28.28 
 
 
334 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.89 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
341 aa  49.3  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2038  DJ-1 family protein  32.12 
 
 
191 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  29.29 
 
 
314 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  32.43 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  32.43 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  29.73 
 
 
182 aa  47  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
334 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1684  ThiJ/PfpI family protein  32.95 
 
 
109 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  32.17 
 
 
691 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3384  ThiJ/PfpI  24.77 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.482439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3446  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.77 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.458276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3395  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.77 
 
 
218 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.372387  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
324 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0802  DJ-1/PfpI family protein  21.8 
 
 
207 aa  45.8  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  25.41 
 
 
326 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  25.41 
 
 
326 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  31.43 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1009  DJ-1 family protein  30.82 
 
 
183 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047613  normal  0.605199 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  31.43 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  31.43 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  25 
 
 
324 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  27.75 
 
 
239 aa  45.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.89 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
326 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 
362 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  31.43 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  29.45 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  29.71 
 
 
321 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2579  ThiJ/PfpI  26.28 
 
 
202 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  31.43 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  31.43 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  25.83 
 
 
358 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  31.43 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3606  ThiJ/PfpI domain protein  39.06 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  22.9 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1622  ThiJ/PfpI  32.17 
 
 
179 aa  43.5  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.91793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  25.77 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  30.77 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  27.72 
 
 
325 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  27.48 
 
 
329 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1677  ThiJ/PfpI domain protein  38.89 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  25.41 
 
 
326 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0928  DJ-1/PfpI family protein  26.86 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0981  ThiJ/PfpI domain-containing protein  27.63 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  30.77 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  28.88 
 
 
319 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  31.54 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.543799 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>