173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1973 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00863935  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2090  ThiJ/PfpI domain protein  38.46 
 
 		 192 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117884  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3357  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  33.91 
 
 		 186 aa  101  6e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000501015  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3342  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.23 
 
 		 190 aa  100  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000897289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3688  thiJ/pfpI family protein  33.91 
 
 		 190 aa  99  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000554437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3408  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  32.18 
 
 		 190 aa  97.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3445  thiJ/pfpI family protein  32.18 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000555251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3715  thiJ/pfpI family protein  32.18 
 
 		 190 aa  96.7  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000105676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3683  thiJ/pfpI family protein  32.76 
 
 		 190 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00698458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3763  thiJ/pfpI family protein  31.03 
 
 		 190 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1553  thiJ/pfpI family protein  29.31 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454916  normal  0.0345603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1791  thiJ/pfpI family protein  31.41 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1492  intracellular protease/amidase  30.37 
 
 		 194 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.882955  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1501  thiJ/PfpI family protein  29.84 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000524776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1529  thiJ/pfpI family protein  29.84 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.695646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1648  thiJ/pfpI family protein  29.84 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1843  ThiJ/PfpI domain protein  31.84 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2291  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.89 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0353  ThiJ/PfpI family intracellular protease  29.15 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2564  ThiJ/PfpI domain protein  27.64 
 
 		 241 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2690  thiJ/pfpI family protein  30.27 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0560939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2475  thiJ/pfpI family protein  29.83 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0918447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2657  thiJ/pfpI family protein  29.83 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4040  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.73 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2674  thiJ/pfpI family protein  29.83 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000490961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2155  ThiJ/PfpI domain protein  25.84 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.663488 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1842  ThiJ/PfpI domain-containing protein  28.96 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000198171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2761  intracellular protease, ThiJ/PfpI family  30.65 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000853116 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2402  ThiJ/PfpI family protein  29.57 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247507  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3664  DJ-1/PfpI family protein  31.25 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2512  ThiJ/PfpI domain-containing protein  25.82 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0808  hypothetical protein  25.79 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0613727 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4072  ThiJ/PfpI domain protein  26.52 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1101  DJ-1 family protein  26.86 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1340  ThiJ/PfpI  25.95 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4315  ThiJ/PfpI domain protein  25.97 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 348 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0523  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  26.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.017348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0681  DJ-1 family protein  26.29 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728078  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0803  DJ-1 family protein  24.34 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl263  putative intracellular protease/amidase  25.4 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.04249e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0569  ThiJ/PfpI domain protein  24.43 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1057  DJ-1 family protein  26.54 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000197778  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2774  DJ-1 family protein  24.86 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  26.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2042  intracellular protease, PfpI family  27.85 
 
 		 173 aa  51.6  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0510  DJ-1 family protein  25.4 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  hitchhiker  0.000981591  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  23.2 
 
 		 331 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3874  DJ-1 family protein  27.81 
 
 		 183 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3645  ThiJ/PfpI domain protein  22.53 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.415005 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4051  intracellular protease, PfpI family  28.85 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  22.41 
 
 		 276 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4141  intracellular protease, PfpI family  28.85 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0371  DJ-1 family protein  25.39 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00995133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11290  DJ-1 family protein  23.96 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000017657  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2566  DJ-1 family protein  21.93 
 
 		 192 aa  49.3  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.290389  normal  0.0127226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  25.44 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0031  ThiJ/PfpI  32.76 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  25.44 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  24.12 
 
 		 192 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5376  intracellular protease, PfpI family  24.68 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0029  DJ-1  24.21 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0908  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.42 
 
 		 189 aa  48.1  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0251  DJ-1 family protein  29.17 
 
 		 180 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  26.38 
 
 		 204 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1633  protein ThiJ  26.01 
 
 		 182 aa  48.1  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0118  DJ-1 family protein  29.17 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2555  twin-arginine translocation pathway signal  20.65 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.739799 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0832  DJ-1 family protein  28.83 
 
 		 180 aa  47.8  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0233882 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0292  DJ-1 family protein  26.04 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00553138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1684  ThiJ/PfpI family protein  34.31 
 
 		 109 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_127  DJ-1, 4-methyl-5(b-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  35.53 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1208  DJ-1 family protein  22.99 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  24.12 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  24.12 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  21.67 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4771  PfpI family intracellular protease  28.3 
 
 		 366 aa  47.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.102673  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0978  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  28.42 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1215  DJ-1  25.4 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1318  peptidase C56, PfpI  25.3 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0833  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis protein  25.56 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000524755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  24.2 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  28.57 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4625  intracellular protease, PfpI family  22.53 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.589393 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  21.84 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  24.2 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 324 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_002950  PG0634  ThiJ/PfpI family protein  28 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.403728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04597  DJ-1/PfpI family  21.99 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0914  4-methyl-5(B-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate biosynthesis enzyme  27.89 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3696  putative intracellular protease  26.72 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.543316 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0894  4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole monophosphate synthesis protein  26.9 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.022908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1436  PfpI family intracellular peptidase  27.43 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.567729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 319 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  26.95 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2941  PfpI family intracellular peptidase  23.73 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.161732  normal  0.711333 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0509  DJ-1 family protein  25.68 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3069  DJ-1 family protein  24.16 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>