155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4629 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4629  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.755709 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4545  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4678  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4538  tetratricopeptide repeat protein  99.13 
 
 		 229 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4629  tetratricopeptide repeat protein  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03950  hypothetical protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3914  Sel1 domain protein repeat-containing protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5584  Sel1 repeat protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03910  hypothetical protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4323  Sel1 repeat-containing protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4634  Sel1 repeat-containing protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3949  Sel1 domain-containing protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4541  Sel1 repeat-containing protein  88.65 
 
 		 229 aa  421  1e-117  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0278  Sel1 domain-containing protein  63.44 
 
 		 224 aa  278  7e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.928415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0019  Hsp12 variant C  29.39 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.99 
 
 		 684 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  32.32 
 
 		 1493 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  30.46 
 
 		 961 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.34 
 
 		 789 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  30.14 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  36.02 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  32.49 
 
 		 1402 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  29.86 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1116  Sel1 domain protein repeat-containing protein  33.67 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0560927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2718  Sel1 domain-containing protein  27.63 
 
 		 254 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1126  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.95 
 
 		 343 aa  61.6  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  27.71 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.29 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0771  hypothetical protein  24.29 
 
 		 331 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.535764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1002 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0758  sel1 repeat-containing family protein  24.59 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0711  Sel1 repeat family  24.38 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.556165  normal  0.833851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  30.98 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0698  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.63 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  33.54 
 
 		 838 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  31.62 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  33.56 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.55 
 
 		 341 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  25.48 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  26.38 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  29.15 
 
 		 552 aa  55.1  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.81 
 
 		 528 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  28.09 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  29.85 
 
 		 2413 aa  54.7  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  26.03 
 
 		 425 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2933  tetratricopeptide TPR_2  33.13 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  29.06 
 
 		 1037 aa  53.9  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0539  hypothetical protein  31.97 
 
 		 503 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0484  hypothetical protein  31.97 
 
 		 503 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0325737 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 		 380 aa  53.9  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  31.68 
 
 		 342 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  29.08 
 
 		 831 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6006  Sel1 domain-containing protein  31.93 
 
 		 321 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0478  hypothetical protein  31.97 
 
 		 503 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1381  tetratricopeptide repeat protein  27.92 
 
 		 509 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.261787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0476  putative periplasmic protein  31.97 
 
 		 503 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  30.57 
 
 		 1877 aa  52.4  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  29.74 
 
 		 490 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1564  tetratricopeptide repeat protein  27.5 
 
 		 509 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  26.88 
 
 		 376 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  27.81 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3437  Sel1 domain protein repeat-containing protein  31.41 
 
 		 278 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1890  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 509 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0490487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1954  tetratricopeptide repeat protein  28.26 
 
 		 509 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  33.11 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.85 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  29.56 
 
 		 557 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  27.35 
 
 		 490 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  28.71 
 
 		 376 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  25.12 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  25.91 
 
 		 393 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0241  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.55 
 
 		 480 aa  50.1  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.381439  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4139  hypothetical protein  32.67 
 
 		 514 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1032 aa  49.7  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 976 aa  49.3  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2511  Sel1-like protein  32.28 
 
 		 287 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2590  Sel1 domain-containing protein  28.4 
 
 		 401 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1708  hypothetical protein  28.43 
 
 		 362 aa  48.9  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1651  hypothetical protein  27.32 
 
 		 362 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.563504  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  32.24 
 
 		 276 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  26.79 
 
 		 331 aa  48.9  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  28.36 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27845  predicted protein  28.97 
 
 		 536 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437559  normal  0.166245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.11 
 
 		 321 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  27.69 
 
 		 416 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 		 392 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2686  hypothetical protein  29.11 
 
 		 365 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.715666  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2564  enhanced entry protein EnhC  30.52 
 
 		 1200 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1457  Sel1  33.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3510  Sel1 domain-containing protein  32.21 
 
 		 512 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.765295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3685  Sel1 domain-containing protein  31.13 
 
 		 512 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0380  hypothetical protein  36.08 
 
 		 319 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0544  hypothetical protein  28 
 
 		 1134 aa  47  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.142127 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2399  Sel1 domain-containing protein  28.65 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  26.15 
 
 		 350 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  29.8 
 
 		 482 aa  46.2  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0442  Sel1 domain-containing protein  31.13 
 
 		 512 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.375518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>