110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0014 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0014  type II secretion system protein  100 
 
 		 322 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0165  AAA ATPase  53.56 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0582  type II secretion system protein  95.96 
 
 		 99 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0609  type II secretion system protein  95.96 
 
 		 99 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.188984 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13870  hypothetical protein  72.41 
 
 		 127 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0708542  normal  0.103824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0878  hypothetical protein  78.75 
 
 		 105 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.962388  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4734  hypothetical protein  79.73 
 
 		 75 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4769  ExeA-like protein  75.71 
 
 		 80 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.43553 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4655  AAA ATPase  46.05 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0883  AAA ATPase  26.77 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  28.74 
 
 		 390 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  29.57 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1031  AAA ATPase  24.91 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.550576  hitchhiker  0.00913297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2717  phage-like protein  25.83 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1395  hypothetical protein  24.51 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  27.17 
 
 		 387 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  27.03 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0215  ATPase  27.05 
 
 		 570 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1030  general secretion pathway protein A  27.73 
 
 		 320 aa  53.1  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00881191 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5571  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.7 
 
 		 395 aa  53.1  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00252  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshM (pilus type IV)  26.98 
 
 		 300 aa  53.1  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  24.19 
 
 		 385 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  26.34 
 
 		 368 aa  52.8  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  27.36 
 
 		 447 aa  52.8  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0555  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0572  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1689  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2502  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.747208 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2927  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600702  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5447  AAA ATPase  25.85 
 
 		 271 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.739293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5029  putative general secretion pathway protein A  26.46 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.372214  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3696  AAA ATPase  26.26 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  25.95 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.91 
 
 		 372 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  29.41 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  25.12 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0324  AAA ATPase  30.92 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0671  AAA ATPase  30.92 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.91 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0837  general secretion pathway protein A, putative  30.92 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  23.85 
 
 		 302 aa  50.4  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.67 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  27.31 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  28.14 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13880  hypothetical protein  77.42 
 
 		 31 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0666347  normal  0.0950561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2231  AAA ATPase  22.49 
 
 		 927 aa  49.3  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.692531  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  27.47 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1924  hypothetical protein  25.41 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.42704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  27.88 
 
 		 349 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  28.5 
 
 		 427 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3505  secretion ATPase  26.32 
 
 		 831 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000001058 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  25.87 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7426  AAA ATPase  28.19 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.6356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3273  MSHA biogenesis protein MshM  27.98 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0550  ATPase, Type II secretory pathway component  26.54 
 
 		 437 aa  48.1  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2472  AAA ATPase  27.22 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1121  putative general secretion pathway protein, ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0709  putative ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278458 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 564 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  28.68 
 
 		 439 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3387  Type II secretory pathway  27.02 
 
 		 284 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5182  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6465  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6581  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.0159835 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7259  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0098  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0129  AAA ATPase  27.52 
 
 		 285 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1995  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.54 
 
 		 549 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0285  ATPase  25.23 
 
 		 341 aa  47  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0455  MSHA biogenesis protein MshM  24.46 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  23.4 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  30.28 
 
 		 395 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3750  MSHA biogenesis protein MshM  23.17 
 
 		 314 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.995764  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  23.43 
 
 		 422 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 557 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2821  MSHA biogenesis protein MshM  29.59 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 557 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 557 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.85 
 
 		 557 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5942  type II general secretion pathway ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00622047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6336  type II general secretion pathway ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000121013  hitchhiker  0.0000465565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0320  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.516384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1999  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2009  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182844  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2406  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000114906  decreased coverage  0.00000352563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2551  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.082817  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2836  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3141  ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3930  type II general secretion pathway ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00167468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4423  type II general secretion pathway ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00207936  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5479  type II general secretion pathway ATPase  30.57 
 
 		 277 aa  46.2  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0903611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.48 
 
 		 562 aa  46.2  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  25.86 
 
 		 393 aa  46.2  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  24.45 
 
 		 519 aa  45.8  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  23.35 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0470  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHM)  24.67 
 
 		 282 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00298128  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  50 
 
 		 1478 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.833442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  26.52 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0561  MSHA biogenesis protein MshM  24.65 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>