196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3930 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_5942  type II general secretion pathway ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00622047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6336  type II general secretion pathway ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000121013  hitchhiker  0.0000465565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0320  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.516384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1999  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2009  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182844  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2406  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000114906  decreased coverage  0.00000352563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2551  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.082817  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2836  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3141  ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3930  type II general secretion pathway ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00167468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4423  type II general secretion pathway ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00207936  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5479  type II general secretion pathway ATPase  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0903611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0324  AAA ATPase  70.08 
 
 		 279 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0671  AAA ATPase  70.08 
 
 		 279 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0837  general secretion pathway protein A, putative  70.08 
 
 		 279 aa  380  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7426  AAA ATPase  65.66 
 
 		 285 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.6356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0098  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5182  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7259  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1121  putative general secretion pathway protein, ATPase  64.91 
 
 		 285 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0709  putative ATPase  64.91 
 
 		 285 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278458 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6465  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157794 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6581  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.0159835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0129  AAA ATPase  64.53 
 
 		 285 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0943  putative ATPase  51.62 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1331  putative ATPase  51.62 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2124  putative ATPase  51.62 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2274  putative ATPase  51.62 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2852  putative ATPase  51.62 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1321  putative ATPase  52.08 
 
 		 310 aa  248  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0460  putative ATPase  53.06 
 
 		 196 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.96 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.73 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  25.84 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  23.95 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.29 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1106  AAA ATPase  26.54 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000143994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.89 
 
 		 613 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 538 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.27 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.49 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  29.34 
 
 		 554 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.09 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  29.34 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  30.81 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.52 
 
 		 572 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.34 
 
 		 557 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.84 
 
 		 587 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  28.02 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.12 
 
 		 364 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 559 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  26.54 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  26.05 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  26.05 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  26.05 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  26.05 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  26.05 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  26.19 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.19 
 
 		 577 aa  70.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2401  ATPas  24.88 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.471861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.35 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  24.43 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  30 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  24.22 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  24.22 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  24.22 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  24.22 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  24.22 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  28.02 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  28.24 
 
 		 563 aa  68.9  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  26.48 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  25.24 
 
 		 584 aa  66.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2525  ATPase  27.83 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0430753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1483  peptidoglycan binding domain-containing protein  24.05 
 
 		 536 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0884  AAA ATPase  25.58 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  25.24 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4238  ATPase  22.79 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.614005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  25.97 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3594  putative general secretion pathway protein A  24.8 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  26.36 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  27.27 
 
 		 536 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  29.04 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  24.32 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  25.12 
 
 		 538 aa  63.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.19 
 
 		 562 aa  63.2  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.78 
 
 		 536 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3115  ATPase  29.63 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.787469  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0930  sporulation domain-containing protein  23.55 
 
 		 740 aa  62.4  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4035  AAA ATPase  28.76 
 
 		 532 aa  62  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.267259  normal  0.70324 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3404  ATPas  27.14 
 
 		 459 aa  62  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  26.78 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0144  AAA ATPase  25.6 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.06 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>