212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6581 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5182  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6581  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.0159835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1121  putative general secretion pathway protein, ATPase  99.65 
 
 
285 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0709  putative ATPase  99.65 
 
 
285 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.278458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0129  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6465  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0098  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7259  AAA ATPase  100 
 
 
285 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7426  AAA ATPase  96.84 
 
 
285 aa  564  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.6356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0324  AAA ATPase  67.99 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0837  general secretion pathway protein A, putative  67.99 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0671  AAA ATPase  67.99 
 
 
279 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5942  type II general secretion pathway ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00622047  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6336  type II general secretion pathway ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000121013  hitchhiker  0.0000465565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0320  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.516384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1999  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2009  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182844  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2406  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000114906  decreased coverage  0.00000352563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2551  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.082817  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2836  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81367  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3141  ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3930  type II general secretion pathway ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00167468  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4423  type II general secretion pathway ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00207936  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5479  type II general secretion pathway ATPase  64.53 
 
 
277 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0903611  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0943  putative ATPase  53.31 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1331  putative ATPase  53.31 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2124  putative ATPase  53.31 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2274  putative ATPase  53.31 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2852  putative ATPase  53.31 
 
 
276 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1321  putative ATPase  53.05 
 
 
310 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0460  putative ATPase  54.08 
 
 
196 aa  198  9e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1106  AAA ATPase  26.72 
 
 
275 aa  90.5  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000143994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  26.04 
 
 
505 aa  89.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  30.67 
 
 
563 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.55 
 
 
558 aa  88.2  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  25.19 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  24.81 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  24.81 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  24.81 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  24.81 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  24.81 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  30.48 
 
 
439 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.92 
 
 
613 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  26.52 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  29.11 
 
 
584 aa  82.4  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.34 
 
 
538 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.41 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  33.33 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.62 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.64 
 
 
577 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.62 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.62 
 
 
557 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.62 
 
 
557 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.64 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.24 
 
 
541 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  27.43 
 
 
563 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.41 
 
 
559 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  27.8 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  27.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  27.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  27.8 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.67 
 
 
557 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22880  General secretion pathway protein A  29.92 
 
 
570 aa  79  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.499914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  27.8 
 
 
266 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  24.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  24.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  24.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  24.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3056  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.86 
 
 
536 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1217  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.86 
 
 
536 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  24.71 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  29.67 
 
 
554 aa  77  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.94 
 
 
572 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.67 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.81 
 
 
372 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  28.71 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  27.03 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  26.64 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.98 
 
 
372 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  26.81 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  23.64 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.22 
 
 
568 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  27.42 
 
 
529 aa  73.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.31 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.87412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.27 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  25.97 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  27.07 
 
 
387 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.83 
 
 
562 aa  72  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  26.64 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  25.81 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.44 
 
 
532 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  26.02 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  25.36 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2688  general secretion pathway protein A  28.64 
 
 
519 aa  69.7  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.387594  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1518  AAA ATPase  25.88 
 
 
371 aa  69.3  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0414498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.94 
 
 
562 aa  68.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  27.23 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  20.45 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>