209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0671 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0324  AAA ATPase  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0976926 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0837  general secretion pathway protein A, putative  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0671  AAA ATPase  100 
 
 		 279 aa  564  1e-160  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5182  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6581  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.0159835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0098  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0129  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1121  putative general secretion pathway protein, ATPase  67.63 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0709  putative ATPase  67.63 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.278458 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7426  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.6356 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7259  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6465  AAA ATPase  67.99 
 
 		 285 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157794 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5942  type II general secretion pathway ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00622047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6336  type II general secretion pathway ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000121013  hitchhiker  0.0000465565 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0320  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.516384 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1999  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0821268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2009  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182844  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2406  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000114906  decreased coverage  0.00000352563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2551  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.082817  normal  0.156391 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2836  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.81367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3141  ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.129618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3930  type II general secretion pathway ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00167468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4423  type II general secretion pathway ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00207936  normal  0.188687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5479  type II general secretion pathway ATPase  70.08 
 
 		 277 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0903611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0943  putative ATPase  54.95 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1331  putative ATPase  54.95 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2124  putative ATPase  54.95 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2274  putative ATPase  54.95 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2852  putative ATPase  54.95 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1321  putative ATPase  55.86 
 
 		 310 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0460  putative ATPase  55.38 
 
 		 196 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3068  AAA ATPase  30 
 
 		 439 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.224747  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1671  type II secretory pathway ATPase ExeA  27.75 
 
 		 505 aa  90.1  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000168756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0835  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.43 
 
 		 613 aa  89  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0972  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 558 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176108  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0686  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.02 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1167  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 538 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110256  hitchhiker  0.000320239 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1829  AAA ATPase  24.62 
 
 		 266 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.569708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2822  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000460224  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1009  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 587 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1297  general secretion pathway protein a  32.54 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1085  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.79 
 
 		 541 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0538082  normal  0.0243335 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2983  peptidoglycan binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 557 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2896  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.495254  hitchhiker  0.000377738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2978  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111666  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3075  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 562 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1156  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3278  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  28.86 
 
 		 364 aa  82.4  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1200  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3157  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.06 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.526164  normal  0.754225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1233  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 557 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.64745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0662  ATPase  30 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1772  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.94 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3281  ATPase  26.94 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1106  AAA ATPase  25.59 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000143994  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1031  general secretion pathway protein A  29.36 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  32.35 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0462  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.24 
 
 		 577 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.388723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0471  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.24 
 
 		 580 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  27.57 
 
 		 427 aa  79  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0024  AAA ATPase  25.67 
 
 		 266 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  30.56 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1116  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1587  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0587648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1982  general secretion pathway protein-related protein  27.94 
 
 		 393 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2219  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  25.51 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0964042  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  28.65 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1711  AAA ATPase  28.46 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0833  ATPase  27.27 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0382  AAA ATPase  24.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1106  AAA ATPase  24.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.597508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0545  AAA ATPase  24.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1875  AAA ATPase  24.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.871076  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1329  AAA ATPase  24.23 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2023  general secretion pathway protein A  27.82 
 
 		 529 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000142113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1683  AAA ATPase  28.08 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2821  AAA ATPase  28.08 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2001  AAA ATPase  28.08 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.249052  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3192  AAA ATPase  28.08 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0103518  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4212  putative general secretion pathway protein A  33.14 
 
 		 563 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001613  general secretion pathway protein A  26.5 
 
 		 538 aa  75.5  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1014  hypothetical protein  29.36 
 
 		 281 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0177  general secretion pathway ATPase protein  26.19 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2981  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.34 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0901758 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0311  AAA ATPase  26.64 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2362  AAA ATPase  23.77 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0329  AAA ATPase  26.64 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  27.63 
 
 		 271 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2221  general secretion pathway protein-related protein  29.43 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2122  AAA ATPase  26.64 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0205  AAA ATPase  28.57 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  26.67 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0637  ATPase  27.27 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2499  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 562 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000546942 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0788  peptidoglycan binding domain-containing protein  25.55 
 
 		 568 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1681  AAA ATPase  26.25 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2300  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.65 
 
 		 532 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0061  general secretion pathway protein A  29.65 
 
 		 549 aa  68.9  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1503  peptidoglycan-binding LysM  26.13 
 
 		 542 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  24.62 
 
 		 422 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>