29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3696 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3696  AAA ATPase  100 
 
 		 299 aa  597  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2717  phage-like protein  27.45 
 
 		 421 aa  62.8  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.874447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1395  hypothetical protein  32.84 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0014  type II secretion system protein  26.26 
 
 		 322 aa  52.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0165  AAA ATPase  32.04 
 
 		 323 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2879  AAA ATPase  27.61 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1766  peptidoglycan binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 564 aa  47  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1148  general secretion pathway protein A  28.16 
 
 		 563 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.873243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3749  ATPase  25.66 
 
 		 271 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2396  Type II secretory pathway component ExeA (predicted ATPase)-like protein  23.93 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3236  AAA ATPase  27.69 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2258  AAA ATPase  27.69 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1286  AAA ATPase  27.69 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1009  AAA ATPase  27.69 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0533  AAA ATPase  27.69 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2852  putative ATPase  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.681908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2274  putative ATPase  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2124  putative ATPase  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1331  putative ATPase  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1321  putative ATPase  28.93 
 
 		 310 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0943  putative ATPase  28.93 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0075  general secretion pathway protein, ATPase  27.11 
 
 		 447 aa  43.5  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.897971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0328  AAA ATPase  29.52 
 
 		 291 aa  43.5  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.799716  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2967  AAA ATPase  23.05 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0977  AAA ATPase  23.4 
 
 		 498 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0423306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0386  type II secretory pathway ATPase ExeA  36.73 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0184909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2026  ATPase  32.58 
 
 		 385 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.328759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0171  MSHA biogenesis protein MshM  23.53 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2509  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  24.05 
 
 		 353 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.87412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>