More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2426 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  100 
 
 
333 aa  682    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  54.68 
 
 
333 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  54.68 
 
 
333 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  54.98 
 
 
333 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  33.7 
 
 
354 aa  151  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
341 aa  149  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  25.85 
 
 
334 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  37.86 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  35.77 
 
 
347 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 
412 aa  73.2  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  41.18 
 
 
350 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
320 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.84 
 
 
320 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
347 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  32.76 
 
 
300 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  25.55 
 
 
334 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  29.91 
 
 
335 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  32.26 
 
 
329 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.74 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  37.23 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  35.05 
 
 
424 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
350 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  30.89 
 
 
389 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.89 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 
346 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  38.61 
 
 
340 aa  58.9  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
336 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
573 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
573 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 
345 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
379 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
283 aa  56.6  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
338 aa  56.6  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
295 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  36.89 
 
 
1007 aa  56.2  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
319 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  36 
 
 
345 aa  56.2  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
285 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 
235 aa  56.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  26.49 
 
 
325 aa  55.8  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  30 
 
 
731 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
970 aa  55.5  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  32.48 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.86 
 
 
1157 aa  55.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 
302 aa  54.3  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  36.27 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  33.02 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  25.56 
 
 
672 aa  53.9  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  35.78 
 
 
297 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  26.63 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
329 aa  53.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
801 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 
289 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.31 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2717  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 
377 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
358 aa  52.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
312 aa  52.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
370 aa  52.8  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.93 
 
 
331 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4716  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
272 aa  52  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4347  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
272 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.963106  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  33 
 
 
1119 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.32 
 
 
341 aa  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1508  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0142825  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1111  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  29.53 
 
 
296 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.78 
 
 
466 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 
335 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1221  glycosyltransferase  32.38 
 
 
310 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.628351  normal  0.475099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 
344 aa  51.2  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  29.6 
 
 
358 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3897  glycosyl transferase family 2  32.65 
 
 
501 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  23.94 
 
 
294 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.41 
 
 
328 aa  50.4  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.45 
 
 
298 aa  50.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
455 aa  50.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1248  glycosyltransferase  31.62 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0573246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  28.07 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  24.49 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
280 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.63 
 
 
729 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
287 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  32.26 
 
 
302 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>