More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0854 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 354 aa  727    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  33.7 
 
 		 333 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  32.71 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  32.71 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  32.71 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 334 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.28 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 353 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  25.51 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2717  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.21 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  37.39 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  29.83 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.91 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 347 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  35.19 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  35.19 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  35.19 
 
 		 309 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  28.42 
 
 		 335 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.75 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 315 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 424 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  34.82 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  25.81 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.25 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  31.67 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  28.95 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  35 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  30.17 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  28.04 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 289 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.01 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 727 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.41 
 
 		 326 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 337 aa  57  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 		 851 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 		 851 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 		 851 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  33.91 
 
 		 851 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 363 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 		 584 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 370 aa  57  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 		 851 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 		 581 aa  57  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.84 
 
 		 853 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  28.04 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  28.04 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.78 
 
 		 853 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.41 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.21 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26500  glycosyl transferase  32.41 
 
 		 632 aa  56.6  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.234854  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.36 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.33 
 
 		 729 aa  56.2  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.04 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 801 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3903  glycosyl transferase family 2  33.62 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.46 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0655  glycosyl transferase  34.04 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0670645  normal  0.883616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  28.45 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3382  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.165683  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  28.45 
 
 		 480 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  32.5 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 349 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  30.28 
 
 		 302 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>