More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2267 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  100 
 
 		 347 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 		 350 aa  242  9e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1970  putative glycosyl transferase (O-antigen related)  29.28 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0672  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.28 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0579  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.28 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1975  hypothetical protein  27.81 
 
 		 348 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 341 aa  93.6  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.96 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  29.28 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  35.77 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  37.6 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  37.6 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  36.8 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  34.51 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 623 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  32 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 334 aa  65.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  31.39 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 703 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 		 1007 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0849  glycosyl transferase family protein  29.51 
 
 		 625 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.33844 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.56 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 		 327 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  32.5 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  32.48 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1111  glycosyl transferase family protein  23.32 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 		 302 aa  57  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2017  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 1032 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.4 
 
 		 1191 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  29.06 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.93 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 851 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.87 
 
 		 851 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1171 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 851 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.13 
 
 		 851 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 1190 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  30.13 
 
 		 851 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  31.62 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  26.72 
 
 		 329 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1492  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 958 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1225  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.086814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 746 aa  54.7  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 643 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  30.43 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 801 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 377 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.57 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  29.09 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1430  beta-1,4-galactosyltransferase, putative  33.05 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  28.21 
 
 		 1739 aa  54.3  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  30.43 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 358 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  28.83 
 
 		 325 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 347 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2010  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 970 aa  54.3  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  34.48 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.64 
 
 		 350 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 336 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.97 
 
 		 235 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>