More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1616 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 350 aa  722    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  36.73 
 
 		 347 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1970  putative glycosyl transferase (O-antigen related)  35.2 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.527664  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0672  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.2 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0579  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.2 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1975  hypothetical protein  34.16 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  36.75 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.57 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 376 aa  82.8  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  32.64 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.15 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  35.51 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 329 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  26.75 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.52 
 
 		 1191 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  32.33 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0024  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.09 
 
 		 373 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.03 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 1198 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2252  glycosyl transferase family 2  33.06 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 746 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2415  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.61 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 1192 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  24.3 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 		 1190 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  35.83 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  30.77 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 296 aa  67  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2010  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 		 360 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 		 353 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 623 aa  66.6  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  24.34 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.15 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  24.87 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.71 
 
 		 312 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  24.87 
 
 		 333 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  29.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  24.27 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.11 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 1007 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  29.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  32.58 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  31.01 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.68 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.41 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.58 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.35 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 		 354 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4280  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1171 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  29.41 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 1739 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  26.09 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.65 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.3 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 1035 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 		 1177 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  31.62 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  30.28 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 970 aa  62.8  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.3 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.08 
 
 		 1177 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.61 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  31.19 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 		 327 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3720  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 1193 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  30.48 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>