More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0702 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
315 aa  645    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1111  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 
337 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.66 
 
 
320 aa  96.7  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  39.82 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  39.02 
 
 
345 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  31.96 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  31.96 
 
 
333 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  32.49 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
412 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  36.36 
 
 
353 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  38.18 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  34.51 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 
424 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
354 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.51 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
324 aa  72.8  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  32.38 
 
 
333 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  34.51 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
350 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
370 aa  68.6  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  32.74 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  36.97 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 
300 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  36.13 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  38.68 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 
480 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.26 
 
 
853 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
853 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  31.82 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0779  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
327 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  33.9 
 
 
334 aa  62  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.17 
 
 
853 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0122  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
378 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000124856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  33.62 
 
 
329 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  36.46 
 
 
350 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
334 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
341 aa  59.3  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.37 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
345 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
851 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
851 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
851 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0331  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.7 
 
 
851 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  28.7 
 
 
851 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4597  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1225  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.086814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0330  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
377 aa  56.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 
329 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
296 aa  55.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 
331 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.26 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  28.3 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2717  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 
377 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2047  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 
105 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  32.41 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  27.12 
 
 
301 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
343 aa  54.3  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  29.36 
 
 
237 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
1007 aa  53.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 
330 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
348 aa  52.8  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3784  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 
320 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01481  hypothetical protein  26.75 
 
 
344 aa  52.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 
285 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  26.55 
 
 
354 aa  52  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  28.45 
 
 
344 aa  52.4  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  24.81 
 
 
729 aa  52.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  31.25 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  32.29 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  29.09 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  27.42 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3721  glycosyl transferase family protein  30.63 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0402  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.137221  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1437  capsular polysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 
324 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0011  putative glycosyltransferase  25.93 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.171814  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3023  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2264  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
270 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.503819  normal  0.135779 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2048  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 
750 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  30.84 
 
 
280 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
234 aa  50.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3218  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
246 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 
573 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>