More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3993 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 334 aa  694    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 354 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  26.57 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  26.54 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  26.54 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  25.85 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  26.54 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  39.82 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 336 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  31.53 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.11 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1616  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3050  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 261 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  33.03 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3739  glycosyl transferase family 2  31.88 
 
 		 701 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  29.55 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1684  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 235 aa  68.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  36.7 
 
 		 261 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 703 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  26.67 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 346 aa  67  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  24.62 
 
 		 309 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  29.36 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 338 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  29.2 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  32.28 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  34.82 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 1739 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1821  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.91 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  28.78 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  25.64 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 317 aa  63.5  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2601  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  26.4 
 
 		 353 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  30.61 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 342 aa  62.8  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  30.84 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2600  glycosyl transferase family 2  28.07 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  23.29 
 
 		 292 aa  62  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0025  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 362 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 		 847 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0735  putative glycosyltransferase protein  33.66 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5207  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  30.56 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1233  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.784226  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1236  glycosyl transferase  29.52 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.215388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  27.78 
 
 		 672 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 		 336 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0853  b-glycosyltransferase  28.18 
 
 		 325 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180683  normal  0.20304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3457  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 		 313 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4906  family 2 glycosyl transferase  34.65 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  28.44 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  29.93 
 
 		 325 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.07 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  28.85 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1097  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  30.89 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.52 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 350 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.65 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  28.87 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  28.57 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 727 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1822  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  27.68 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  26 
 
 		 731 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  30.7 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>