More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3665 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4742  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 424 aa  872    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.877502 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3665  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 424 aa  872    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0894681  normal  0.744723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  33.66 
 
 		 412 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  34.31 
 
 		 412 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  36.57 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.9 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0702  glycosyl transferase family 2  43.16 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  40.17 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  39.45 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  32.81 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1109  glycosyl transferase family protein  38.95 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3130  family 2 glycosyl transferase  42.11 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.17904  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 329 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.1 
 
 		 853 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1225  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.086814 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  23.86 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.83 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.14 
 
 		 853 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6302  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.36 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1120  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 		 324 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0838715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 300 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  29.91 
 
 		 308 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  27.94 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1979  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  34.71 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1111  glycosyl transferase family protein  37.89 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  23.28 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 623 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1101  glycosyltransferase  33.14 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1326  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0812  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.87 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 		 235 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0708  glycosyltransferase  27.87 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.93 
 
 		 251 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.36 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.36 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.36 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 354 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2047  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 105 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  39.36 
 
 		 851 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  32.2 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2010  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1127  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1107  glycosyltransferase  33.33 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.174738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  39.36 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1219  group 2 family glycosyl transferase  33.33 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1288  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.679665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1364  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.857643  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  39.36 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.36 
 
 		 851 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 315 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2252  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  39.36 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  24.46 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  35.05 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0668  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.01 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.576238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0574  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.01 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 		 280 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1966  putative glycosyl transferase  33.01 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.752559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  30.3 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 		 336 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2517  putative glycosyl transferase  38.82 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.02223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  29.84 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1672  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.365918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3120  family 2 glycosyl transferase  31.11 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  34 
 
 		 801 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0269  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.33 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.36 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 1250 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1607  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>