More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4800 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 330 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  47.99 
 
 		 322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  42.8 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 596 aa  188  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  34.5 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  37.38 
 
 		 329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  35.91 
 
 		 801 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  35.22 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.08 
 
 		 298 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  31.8 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.23 
 
 		 311 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 		 311 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1419  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 		 345 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  32.05 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.41 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.7 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  27.7 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  41.74 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  30.7 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  38.24 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.53 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  38.76 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  37.78 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.22 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.74 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 329 aa  75.9  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 1035 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  39.39 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  32.78 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  34.45 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.25 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 573 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  38.66 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.14 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 		 338 aa  69.7  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  29.01 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 703 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.82 
 
 		 466 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  33.62 
 
 		 332 aa  67  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 		 347 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  38.38 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  28.88 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1615  glycosyl transferase family 2  34.92 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665959  normal  0.16082 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.18 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.61 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  34.62 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.33 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  34.19 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2943  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 		 332 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1242  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.77 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.59 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  39.18 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  33.91 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2241  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0769  glycosyl transferase family protein  33.53 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 1250 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0687  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  38.39 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>