More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3837 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
276 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  44.57 
 
 
322 aa  244  9e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  42.59 
 
 
330 aa  209  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  44.59 
 
 
316 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 
596 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  41.28 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
801 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  37.1 
 
 
285 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  39.91 
 
 
336 aa  154  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  35.08 
 
 
311 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  36.41 
 
 
329 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.31 
 
 
311 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
336 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1419  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.56 
 
 
345 aa  104  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.958306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
319 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3070  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
317 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.976972  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3180  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.04 
 
 
298 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  26.67 
 
 
333 aa  95.9  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.37 
 
 
326 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.37 
 
 
326 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.01 
 
 
326 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.06 
 
 
326 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
326 aa  86.3  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  25.88 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.26 
 
 
321 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  27.44 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2881  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
727 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 
358 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3057  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 
318 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.48 
 
 
1250 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3748  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  24 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
322 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  26.27 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  25.4 
 
 
343 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  29.5 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.39 
 
 
341 aa  72.4  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
327 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.63 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.08 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
277 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  32.87 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
318 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3408  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3408  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 
323 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
1035 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.39 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  25.89 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  24.56 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 
333 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1778  glycosyl transferase family 2  23.85 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.18 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  25.66 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  31.62 
 
 
341 aa  68.9  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  27.39 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  27.76 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.13 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
280 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 
299 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
573 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  27.09 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
373 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 
329 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  22.83 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  26.55 
 
 
663 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  30.6 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
361 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 
1038 aa  67  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0309  glycosyl transferase family 2  44.34 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000259013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  36.67 
 
 
372 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.91 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00201  glycosyl transferase  26.21 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4135  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1239 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0317  glycosyl transferase family protein  25.56 
 
 
329 aa  66.6  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0399103  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 
703 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>