More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4043 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4043  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 319 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2348  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 596 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11553  sugar transferase  35.68 
 
 		 357 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11550  sugar transferase  33.74 
 
 		 336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 801 aa  122  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4800  glycosyl transferase family 2  27.33 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0196264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3837  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0769  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  32.71 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0318  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0743987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5180  glycosyl transferase family 2  32.42 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.48188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  30.84 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.4 
 
 		 341 aa  83.6  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.84 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 325 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.14 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 1250 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.35 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3223  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0595343  normal  0.234562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 		 341 aa  72.4  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.15 
 
 		 321 aa  72  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 338 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  25.69 
 
 		 390 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1817  glycosyl transferase family 2  26.62 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.296276  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  26.03 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.37 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 		 244 aa  69.3  0.00000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2592  glycosyltransferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 321 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  27.88 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.09 
 
 		 367 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3441  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0353  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  26.27 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 325 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  32.43 
 
 		 276 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  36.51 
 
 		 727 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 		 305 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 338 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3723  hypothetical protein  31.4 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  22.61 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 1038 aa  65.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  26.79 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.84 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  29.23 
 
 		 350 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1628  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.58 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.21 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  27.53 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1625  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0209  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 102 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000668914  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  27.4 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1200  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  27.57 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2949  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.384487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.22 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  26.24 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  22.43 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  25.84 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0632  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 		 354 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.614152 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1378  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.687728  hitchhiker  0.00000635475 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 		 299 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.32 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2105  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.68 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0121105  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  23.66 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12951  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.47 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.00175067  normal  0.0957676 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0005  glycosyl transferase  31.36 
 
 		 708 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.164795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>