272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3187 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_3187  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
320 aa  654    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.225557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2426  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  36.89 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321095  hitchhiker  0.000629694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2320  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  34.82 
 
 
333 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.0134231 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2212  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  33.93 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00113687  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2313  O antigen biosynthesis abequosyltransferase RfbV  33.93 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0297459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0390  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
341 aa  64.3  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
1250 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0854  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
354 aa  63.5  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
353 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3321  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.83 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3284  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.83 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0268448  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3236  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.83 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3582  group 2 family glycosyl transferase  35.83 
 
 
851 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1948  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.96 
 
 
853 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3536  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.83 
 
 
851 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000936493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  31.85 
 
 
311 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2269  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.34 
 
 
320 aa  60.1  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000162066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2207  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 
335 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2026  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.58 
 
 
853 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.739679  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  28.93 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1152  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
370 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.186653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2171  glycosyl transferase family 2  29.55 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
350 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3380  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.17 
 
 
853 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.74419e-17 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2528  glycosyl transferase family 2  32.79 
 
 
307 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.591132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0642  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  25.44 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.47 
 
 
351 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  22.48 
 
 
672 aa  54.7  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1565  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
970 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000603283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
336 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.54 
 
 
336 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0631  glycosyltransferase protein  24.11 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  26.61 
 
 
309 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 
372 aa  53.5  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2336  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
285 aa  53.5  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.549316  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 
334 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1967  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  27.02 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1497  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2267  rhamnosyl transferase  34.19 
 
 
347 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000303099 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1683  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1615  group 2 family glycosyl transferase  29.08 
 
 
266 aa  53.5  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.653601  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4507  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
412 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0440625  normal  0.0902587 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.36 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  29.69 
 
 
334 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4215  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
412 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1469  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.08 
 
 
266 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000134346  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1257  glycosyl transferase family protein  32.65 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0852  b-glycosyltransferase  22.86 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139255  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
689 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 
335 aa  52.8  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
338 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
241 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1796  glycosyltransferase  27.66 
 
 
249 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0123  glycosyl transferase family 2  33.02 
 
 
480 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000103201  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0888  b-glycosyltransferase  24.34 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236559  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.81 
 
 
329 aa  52  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  26.35 
 
 
623 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1651  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
266 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3188  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
299 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
303 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 
342 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 
341 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3694  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.09 
 
 
266 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3993  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.44972  normal  0.974953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.66 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  24.55 
 
 
346 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0710  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0739  glycosyl transferase family 2  31.62 
 
 
348 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.646928  normal  0.825745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4082  glycosyltransferase  28.57 
 
 
308 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1547  glycosyl transferase family 2  25.17 
 
 
326 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  26.21 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.21 
 
 
329 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1548  glycosyl transferase family 2  25.93 
 
 
235 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.40436  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1259  glycosyltransferase  27.86 
 
 
308 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0753  glycosyl transferase family protein  24.04 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.82 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11552  hypothetical protein  23.42 
 
 
319 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3952  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
328 aa  50.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 
344 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 
300 aa  49.7  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1122  glycosyl transferase family protein  32.04 
 
 
364 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0124  glycosyl transferase family 2  30.65 
 
 
345 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000042136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26.5 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  25.41 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
313 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.67 
 
 
466 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1697  glycosyl transferase family 2  29.51 
 
 
366 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.696391  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1114  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
308 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2187  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804947  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2388  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
1007 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257411  hitchhiker  0.0000141924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>