278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0653 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  65.3 
 
 
264 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  57.99 
 
 
271 aa  293  3e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.92 
 
 
261 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50 
 
 
277 aa  219  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.38 
 
 
263 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.16 
 
 
269 aa  214  9e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.75 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.92 
 
 
270 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.07 
 
 
259 aa  205  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.47 
 
 
264 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.42 
 
 
268 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  49.81 
 
 
259 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.62 
 
 
267 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.61 
 
 
260 aa  199  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  50.18 
 
 
266 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.48 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  39.47 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.39 
 
 
262 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.98 
 
 
261 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.01 
 
 
262 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.03 
 
 
260 aa  194  2e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  49.82 
 
 
266 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.02 
 
 
262 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  41.24 
 
 
264 aa  192  4e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  49.44 
 
 
266 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.61 
 
 
261 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  40.98 
 
 
263 aa  191  8e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  45.19 
 
 
273 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
270 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  42.6 
 
 
262 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 
262 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  44.57 
 
 
263 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.27 
 
 
264 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  41.48 
 
 
262 aa  187  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  40.07 
 
 
270 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  46.59 
 
 
263 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.9 
 
 
262 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.07 
 
 
266 aa  184  9e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  41.11 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.11 
 
 
262 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  40.44 
 
 
263 aa  182  7e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.44 
 
 
287 aa  179  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.67 
 
 
258 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.27 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.88 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.09 
 
 
263 aa  179  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  38.38 
 
 
263 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  37.41 
 
 
261 aa  177  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  43.66 
 
 
281 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  41.04 
 
 
265 aa  176  5e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.27 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  36.63 
 
 
261 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.53 
 
 
261 aa  169  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  36.12 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.22 
 
 
273 aa  165  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  42.54 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.86 
 
 
260 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  39.34 
 
 
266 aa  159  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.87 
 
 
275 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.7 
 
 
264 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  36.53 
 
 
266 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  37.13 
 
 
266 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  36.46 
 
 
268 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.58 
 
 
265 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.91 
 
 
263 aa  143  3e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  36.62 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  30.93 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  30.99 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.12 
 
 
299 aa  115  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  30.04 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0187  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.64 
 
 
280 aa  113  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3538  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.72 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00577442 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.66 
 
 
298 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.13 
 
 
302 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  32.19 
 
 
292 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1761  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  106  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1759  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2074  hypothetical protein  34.6 
 
 
297 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1696  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  105  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.778607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2532  hypothetical protein  32.92 
 
 
301 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.371026  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1580  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1698  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874362  normal  0.235458 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2623  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  30.94 
 
 
280 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00658693  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1645  hypothetical protein  34.04 
 
 
297 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.57 
 
 
292 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2183  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.18 
 
 
297 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1710  hypothetical protein  34.18 
 
 
297 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.941652  normal  0.175263 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2192  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  102  5e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1548  hypothetical protein  33.62 
 
 
297 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.23 
 
 
302 aa  102  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0680  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.89 
 
 
283 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000121985 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.99 
 
 
299 aa  102  9e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10910  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.06 
 
 
285 aa  99.8  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.928492 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1510  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.57 
 
 
276 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2998  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.54 
 
 
300 aa  99  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.562415  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.1 
 
 
292 aa  96.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.99 
 
 
299 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>