277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0790 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0790  phenazine biosynthesis protein PhzF family  100 
 
 
263 aa  523  1e-147  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0096  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  60.9 
 
 
267 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1284  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.63 
 
 
273 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0628  phenazine biosynthesis protein PhzF family  52.29 
 
 
266 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1565  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50.76 
 
 
261 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18020  PhzF family phenazine biosynthesis protein  50 
 
 
261 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.229067  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2134  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.19 
 
 
263 aa  218  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2465  hypothetical protein  52.9 
 
 
259 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1103  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  50 
 
 
277 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28280  PhzF family phenazine biosynthesis protein  51.74 
 
 
259 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00267906  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1349  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.94 
 
 
258 aa  215  7e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4529  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.01 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765532  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8947  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.81 
 
 
262 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1877  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.88 
 
 
261 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0771  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.53 
 
 
263 aa  207  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.659452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3344  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.06 
 
 
268 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2070  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.78 
 
 
275 aa  203  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.35447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4367  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  45.66 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3058  hypothetical protein  41.86 
 
 
265 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000768141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2693  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.65 
 
 
264 aa  198  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1552  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.11 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.857589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4315  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.11 
 
 
262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.366101  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3642  PhzF family phenazine biosynthesis protein  49.22 
 
 
262 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0208065  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2098  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.86 
 
 
269 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3883  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.73 
 
 
262 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0616  PhzF family phenazine biosynthesis protein  48.47 
 
 
270 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.404723  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2845  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.01 
 
 
273 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.236505  normal  0.471671 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3143  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.36 
 
 
260 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.373465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2672  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.53 
 
 
262 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4473  PhzF family phenazine biosynthesis protein  47.21 
 
 
277 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278924  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0653  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  46.59 
 
 
273 aa  187  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.157339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1124  PhzF family phenazine biosynthesis protein  41.83 
 
 
259 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2001  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.8 
 
 
287 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0211  hypothetical protein  41.31 
 
 
264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3504  PhzF family phenazine biosynthesis protein  44.28 
 
 
281 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.281882  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0573  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  48.48 
 
 
266 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4574  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.15 
 
 
260 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00533064  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1598  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  47.69 
 
 
264 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.847307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0989  phenazine-like biosynthesis protein  40.91 
 
 
263 aa  179  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598359  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0600  phenazine biosynthesis protein PhzF family  47.53 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0608  phenazine biosynthesis protein PhzF family  48.29 
 
 
266 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4752  PhzF family phenazine biosynthesis protein  45.21 
 
 
264 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460768  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0023  phenazine biosynthesis protein PhzF family  41.41 
 
 
258 aa  177  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3116  PhzF family phenazine biosynthesis protein  37.64 
 
 
263 aa  175  8e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00210126  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01000  phenazine biosynthesis protein PhzF family  43.98 
 
 
261 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.265489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1583  PhzF family phenazine biosynthesis protein  46.13 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0540164 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1495  hypothetical protein  37.64 
 
 
261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1488  hypothetical protein  37.26 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0046  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  44.4 
 
 
271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.815989  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0415  phenazine biosynthesis protein  37.93 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1102  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  41.44 
 
 
263 aa  171  9e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1968  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40 
 
 
267 aa  169  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00736521  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02191  phenazine biosynthesis protein, PhzF family  40.23 
 
 
263 aa  169  4e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1431  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.53 
 
 
268 aa  168  7e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.127406  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06618  epimerase  41.89 
 
 
266 aa  168  8e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0915  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.82 
 
 
270 aa  168  8e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.577735  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001406  phenazine biosynthesis PhzF family protein  41.6 
 
 
263 aa  168  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1211  hypothetical protein  40.23 
 
 
262 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1217  hypothetical protein  39.85 
 
 
262 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1506  putative phenazine biosynthesis-like protein  38.52 
 
 
266 aa  166  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0733788  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3444  phenazine biosynthesis protein PhzF family  44.02 
 
 
282 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0134295 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1499  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  39.7 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0704716  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1106  phenazine biosynthesis protein PhzF family  39.69 
 
 
262 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0671  seryl-tRNA synthetase (Serine--tRNA ligase; SerRS)  41.51 
 
 
210 aa  158  7e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000097  phenazine biosynthesis PhzF family protein  38.66 
 
 
266 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.55856  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.15 
 
 
300 aa  154  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2334  PhzF family phenazine biosynthesis protein  40.84 
 
 
281 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.486392 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2294  PhzF family phenazine biosynthesis protein  35.11 
 
 
265 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0589  PhzF family phenazine biosynthesis protein  42.37 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00061091 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0048  phenazine biosynthesis protein PhzF family  29.32 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.521637  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2513  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.9 
 
 
298 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120711  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3317  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.86 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0849237  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0760  PhzF family phenazine biosynthesis protein  29.79 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000390  phenazine biosynthesis protein PhzF  32.07 
 
 
251 aa  116  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.320249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2240  PhzF family phenazine biosynthesis protein  34.64 
 
 
299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000508525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2742  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.93 
 
 
299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1331  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.78 
 
 
299 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2951  phenazine biosynthesis protein PhzF family  36.49 
 
 
278 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2594  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.99 
 
 
302 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.875415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2585  phenazine biosynthesis protein PhzF family  35.59 
 
 
289 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0793  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.33 
 
 
276 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.92488  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2184  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  27.57 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000556407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0485  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.14 
 
 
292 aa  98.6  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0927  hypothetical protein  31.09 
 
 
279 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2271  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.92 
 
 
293 aa  96.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1516  phenazine biosynthesis protein PhzF family  32.09 
 
 
298 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6161  PhzF family phenazine biosynthesis protein  31.49 
 
 
292 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2789  phenazine biosynthesis protein PhzF family  33.7 
 
 
305 aa  95.5  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00277552  hitchhiker  0.000013818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3359  phenazine biosynthesis PhzC/PhzF protein  28.76 
 
 
302 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452049  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5032  phenazine biosynthesis protein PhzF family  34.97 
 
 
288 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5621  PhzF family phenazine biosynthesis protein  30.45 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409041  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2754  phenazine biosynthesis protein PhzF family  31.27 
 
 
298 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46420  Phenazine biosynthesis PhzC/PhzF-like protein  30.34 
 
 
292 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4230  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.71 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825535 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4191  phenazine biosynthesis protein PhzF family  28.71 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2389  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.92 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1498  hypothetical protein  28.15 
 
 
300 aa  94  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1448  PhzF family phenazine biosynthesis protein  32.98 
 
 
291 aa  94  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959683  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2310  PhzF family phenazine biosynthesis protein  33.21 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1937  PhzF family phenazine biosynthesis protein  28.92 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.486522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>